纽约(Genomeweb) - 研究人员对乳糜泻样品进行了RNA测序,发掘遗传签名可以帮助识别这些患者的潜在疗法。
由哈佛医学院和再生药物的调查人员领导,该团队使用了在肠样品中的基因表达签名,仔细看看腹泻病的途径一般,以及特异于免疫相关的麸质的活性形式的表达变化不耐受条件。
“我们的调查结果为未来的验证研究提供了框架,以研究乳糜泻疾病发病机制的早期步骤,并审查缓解国,”乳糜泻儿童群体综合医院的临床主任敏园伦纳德(Ceriac Research Anderation)的临床主任一份声明。
为了学习,昨天发表了PLOS ONE,Leonard和其他调查人员在群众综合医院的儿童和其他地方与Regeneron合作,在具有活跃的乳糜泻,15只乳糜泻对照的十几个个体上进行RNA测序,以及15名乳糜泻对照,和15名患有乳糜疾病的人缓解并显示出没有持久的肠损伤。
“通过进行RNA测序,我们发现额外的遗传性”签名“并更接近识别未来治疗剂的目标 - 在乳糜泻和可能的其他自身免疫条件下,”伦纳德说。
除了在活性病例和缓解情况下存在的先天免疫基因表达,例如,该团队鉴定了似乎在来自个体的肠组织中肠组织的高于常见水平的免疫应答,细胞粘附和抗缩体组基因。活跃的乳糜泻。
“[t]霍尔侧重于患者患者患者的分子签名,无论疾病活动如何以及区分患者从患者的缓解中与患者(乳糜泻)分化为缓解,”我们涉及涉及的涉及的途径,不仅可以在Δs,而且在其他慢性炎症疾病中。“
该团队指出,过去的研究在人白细胞抗原(HLA)免疫区域之外的一些57个基因在人体白细胞抗原(HLA)免疫区域之外。即便如此,迄今为止,HLA内外发现的危险因素似乎在先前的家庭研究中解释了对乳糜泻的遗传性的不到一半。
对于新的分析,研究人员使用Illumina成对末端读取,以对来自有或没有活性乳糜泻的个体的样品进行转录组宽的RNA测序,重点关注来自小肠的十二指肠部分的样品。随着转录组数据,它们的重点是免疫相关的基因签名,似乎区分活性乳腺病例和缓解剂。
该团队还对来自参与者的全血样品的HLA键入或RNA测序,确认腹腔疾病样品的关键表达在RT-PCR中偏移。
虽然所有乳糜泻似乎都似乎在肠道中改变了先天的免疫活动,但研究人员确定了对活性乳糜泻患者特异性的转变:其中,粘膜细胞粘附,细胞周期,细胞因子和趋化因子信号的表达变化他们注意到,主要排列的基因 - 结果,提出了先前发表的基因组 - 宽协会研究和乳糜泻的免疫分析。
“一起,我们的研究结果支持微生物组,先天免疫反应和[腹泻]的发展之间的可能联系,”作者写道,“并突出了未来验证的可能协会可能导致对这些步骤的关键知识导致贫民损失镇痛。“