纽约-太平洋生物科学公司本周提供了更多关于其即将上市的短读测序平台Onso的信息,包括耗材定价。
一个300循环的试剂盒,产量在120 Gb到150 Gb的范围内,将花费1995美元,或大约每Gb 15美元。根据该公司的说法,一个产量在80gb到100gb之间的200循环试剂盒的价格为1695美元,或每Gb约19美元。
在周四举行的“基因组生物学与技术进展”(Advances in Genome Biology and Technology)年会上,PacBvwin德赢ac米兰合作io公司高级员工产品经理Young Kim表示,定价在一定程度上取决于该平台基于其高精度可以为用户节省的测序量。
他展示了两次内部测试的数据,表明90%的基地的质量分数远远高于Q40,准确率为99.99%。一次测试在Q46上有90%的碱基,在2X 150 bp上有7.37亿读数,产量为111 Gb。另一组在Q44中有90%的碱基,读取量为6.17亿次,产量为93 Gb。Kim表示,该公司正在优化集群密度,并“有望”达到每个流单元8亿次读取的规格。
他认为,在低覆盖率的情况下,这种准确性将与其他高覆盖率的短读平台的性能相匹配,用于癌症小组确定低频突变或其他“大海捞针”分析。
Kim展示了来自两个未命名的靶向癌症小组的数据,通常分别在未指明的竞争对手的平台上以25,000倍和35,000倍的覆盖率运行。Onso能够分别在6,250倍和8,750X覆盖率下获得类似的灵敏度来检测突变。他声称,与竞争对手的短读序列进行测序的成本为699美元,而Onso只需300美元,即每个样本的成本降低了57%。
Onso的应用将超越癌症组织测试,扩展到单细胞分析。在他的演讲中,Kim展示了使用10x Genomics的单细胞基因表达试剂盒分析10000个单个细胞的数据。他说:“我们可以提供广泛的流行测序应用,而不仅仅是大海捞针。”