纽约——在中国西南部发现的一名晚更新世女性的古代DNA序列表明，该地区是独特的、相对多样化的人口的家园，包括一个与现在东亚和其他地方的人口有关的谱系，以及与最早在美洲定居的土著人口有关的谱系。
在一个纸出现在当代生物学周四，来自中国科学院、云南文物考古研究所和其他研究中心的研究人员利用溶液DNA捕获和霰弹枪测序技术，从中国云南省一个洞穴中发现的遗骸中，将一个线粒体基因组和一个低覆盖率的核基因组组合在一起。
研究人员解释说，该样本来自一位名叫MZR的古代女性，她生活在距今约1.4万至1.47万年前的晚更新世时期。此前的一系列人类学分析表明，MZR的身体和形态特征与解剖学上的现代人(AMH)和古代古人类(包括尼安德特人的头骨特征)都很相似。
新的古基因组序列数据“证实[MZR]具有多种遗传成分，代表了早期的多样化种群，表明东亚南部晚更新世时期的AMH谱系比之前认为的更加多样化。”高级通讯作者、中国科学院昆明动物研究所研究员Bing Su和他的同事解释道他指出，这项工作“为探索早期古人类形态复杂性的遗传学解释铺平了道路”。
从头盖骨样本中提取古DNA后，研究人员依靠改良的人类全基因组探针获取类似人类的序列，用于后续的扩增和文库准备步骤。有了几十个DNA文库，他们最终产生了数亿次序列读取，提供了一个低覆盖率的核基因组和一个平均深度约为125倍的线粒体基因组。
尽管在古人类身上发现了类似古人类的特征，并且存在从丹尼索瓦人和尼安德特人身上渗透而来的古老序列，但研究团队的分析表明，MZR是“早期多样化”的AMH谱系的一部分，与现有种群有遗传联系。
当他们把古代基因组和来自全球人口的古代和当代个体的序列放在一起考虑时，研究人员发现，MZR携带的东亚南部地区的祖先与美洲原住民的祖先有关，这与跨越白令海峡的迁徙涉及从东亚南部迁移到西伯利亚的个体的观点一致。
“我们的研究结果表明，MZR是一个现代人类，代表了东亚早期的多样化谱系，”作者报告说，并指出“MZR与东亚血统有很深的联系，这对第一批美国人有贡献。”
与此同时，在线粒体DNA方面，研究人员发现MZR属于一个母系，似乎是M9线粒体单倍群的基础，其当今的分支被认为在28000年前从东亚大陆向南向北迁移，并进入东南亚、所罗门群岛等地区。
作者解释说:“MZR[个体]灭绝的基础M9谱系的发现表明，晚更新世时期东亚南部的人类种群具有丰富的母系多样性。”
该研究的作者们表示，总的来说，新的基因组研究支持了这样一个观点:来自南亚遗址的古代人口在基因上有细微差别，比在东亚或东南亚更北部的遗址发现的人有更明显的遗传特征。
据报道，该团队预计将对来自中国南方和东亚其他地区的更多古代个体进行测序，包括出现在《古兰经》中确定的那些人之前的个体马鹿洞，也就是MZR尸体被发现的地方。
Su在一份声明中说:“这些数据不仅将帮助我们更完整地描绘我们的祖先是如何迁移的，还包含了关于人类如何随着时间的推移而适应当地环境而改变外貌的重要信息。”