纽约 - 研究人员已在多祖先队列中识别了几乎三十三种基因,与血脂水平相关,这是动脉粥样硬化心血管疾病的危险因素。
虽然以前的基因组 - 范围的协会研究将超过400个遗传基因群与血脂水平联系起来,但这些基因座在脂质特征中发现的9%和12%的表型方差。
在一项新的研究中,一个国际研究人员团队对血脂水平的基于基础的结合测试,利用超过170,000名祖先的数据集进行稀有和可能的基因变体。像他们报道于此美国人遗传学杂志在星期一,研究人员确定了35个与循环脂质水平相关的基因,包括先前未与脂质水平相关的基因,包括在不同血项的个体中发现的基因。
“我希望与我们在一个祖先只看到的人中,在多个祖先中的多个祖先相关的基因是更加强大的发现,”来自波士顿大学公共卫生学院的高级作者Gina Peloso在一封电子邮件中表示。“我们可能没有在多个祖先相关的基因中看到相同的变体,但发现在不同的祖先相关的遗传变异有助于我们交叉验证协会。”
这些基因进一步富集胆固醇降低药物的靶标,并表明与其他研究相反,位于最接近GWAS指标SNP的基因通常是功能基因。
对于他们的分析,研究人员组合来自四种来源的数据,这些来源与血脂级别信息一起分配全面或基因组排序数据,并且总的来说,他们的数据集包括超过170,000人,其中包括97,493名欧洲人,30,025名南亚,16,507名非洲人,16,440名西班牙裔或拉丁美洲,10,420个东亚和1,182个萨摩亚人。
同时,研究人员专注于六种脂质表型以进行分析,包括总胆固醇,LDL-C1,HDL-C,非HDL-C,甘油三酯和TG:HDL。
在一个单变种关联分析中,研究人员发现与这些不同的脂质特征相关的数百种罕见的编码变体。但是,通过进行基于基于转录变异的基因分析,它们在35个基因中归巢,其达到稀有的显着意义。研究人员注意到的大多数这些基因与多于一种脂质特征有关。其中十个以前没有与血脂表型相关联。
研究人员发现,最多27个这些基因位于血脂性状的GWAS指数的SNP中,位于GWAS指数的SNP内。他们进一步研究了这些基因是否与相应的脂质测量有关,发现它们是,表明最接近的基因对于非编码GWAS信号最有可能是因果的,应该优先考虑随访。然而,他们注意到,一些以前的研究已经发现GWAS信号的最接近的基因没有显示出与研究表型的关联。
“这可能是由于我们测试的变异类型 - 罕见的蛋白质改变变异 - 与可能影响基因调节机制的变异相比,”佩洛佐“指出。
通过基于基于基于基于基于基于基于基于基于基于基于基于基于基于基因的基因在祖先群体中广泛一致。例如,与HDL-C相关的17个基因中的三种表明,在极宽的显着性中,至少两个血汁基团中的关联,而第14个基因中的五种基因与总胆固醇组合的,并且有四种与非HDL-C做了。
他们进一步报道,这些基因富含LDL-C药物靶标。“虽然我们识别的基因可能代表药物目标,但进一步的工作是确定这些基因是否是可涂无毒性的,并影响临床事件,”她补充说。