纽约——一个由德国和美国的研究人员领导的国际研究小组已经对一些古代基因进行了测序沙门氏菌基因组，在同一谱系中发现了一群相对不特化的细菌，它们产生了人类特异性病原体美国血清甲型副伤寒C。
研究人员报道他们的研究结果周一在自然生态与进化美国也出现了面向特定主机的转变美国血清在农业生活方式较多的文化中出现的菌株。
马克斯·普朗克人类历史科学研究所的考古遗传学研究人员约翰内斯·克劳斯和亚历山大·赫比格写道:“细菌基因组比较表明，早期的古代菌株不是宿主特异性的，在致病潜力上存在差异，并且经历了与下游宿主适应相伴随的聚合伪化。美国血清与人类文化转型有关。”
研究小组重点研究了新石器时代，认为在从觅食生活方式向更依赖农业和畜牧业的文化过渡期间，人类与家畜的密切接触可能导致了细菌病原体的增加，这些病原体在人与动物之间来回交换。
作者写道:“支持这一假设的直接分子证据——比如古代DNA——目前缺失。”“微生物古基因组学为了解过去人类传染病负担提供了一个独特的窗口，并有望阐明临床相关病原体的深层进化史。”
在筛选了来自古人类骨骼的2700多个宏基因组序列后，克劳斯、赫比格和同事们集中研究了8个沙门氏菌血清亚种血清从采食者、牧民和农牧群体中分离出的个体。从那里，他们依靠在溶液中捕获来抓取美国血清来自俄罗斯、瑞士、土耳其和意大利的古代骨骼样本的分离物大约有1500到6500年的历史，最终对其中8人的基因组进行了测序美国血清隔离。
“这八种细菌基因组横切了4700年的历史美国血清“在[农业]牧民生存传播期间的感染，”作者指出，“并且可以提供一个前所未有的视角来观察物种的多样性和进化。美国血清在这个变革时期。”
当研究小组分析了来自古代昆虫的全基因组序列和2961个现代昆虫的可用序列时美国血清研究人员发现了一个被称为“古代欧亚超级分支”(AESB)的集群，其中包含了早期形式的古欧亚超级分支美国血清没有宿主特异性。
“尽管有很高的遗传多样性美国血清在美国，所有古代细菌基因组都聚集在一个以前未被表征的分支中，该分支含有美国血清适应多种哺乳动物。”“所有来自史前(农业)牧民的古代细菌基因组都属于这个分支的一部分，也包括人类特有的美国血清副伤寒C，说明了人类病原体在5000年期间的进化。”
与此同时，通过为数百个AESB谱系的现代成员带来可用的序列数据，研究人员在人类生活方式转变的背景下，在更广泛的集群中，系统遗传学地追溯了宿主特异性和致病性谱系的出现。他们特别强调了二十多个基因，这些基因在宿主专门化的谱系中通过趋同进化经历了多次伪化事件。
“AESB有六种不同的宿主适应美国血清研究人员在报告中指出，“所有现代适应宿主的血清都携带大量不同的假基因，而不考虑亲缘关系，这与之前的研究结果一致。美国血清这表明了伪基因的原始独立进化。然而，独立形成的共享假基因可能代表了宿主适应所必需的关键变化。”