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从正常膀胱的体细胞突变模式中收集到的癌症线索

纽约-通过从膀胱癌患者或非膀胱癌患者的膀胱样本中收集的序列数据,一个国际团队发现了在老年人或患病个体的正常膀胱尿路上皮样本中积累的体细胞突变、克隆选择模式和突变特征。

维康桑格研究所癌症、衰老和体细胞突变研究员、资深作者Iñigo Martincorena在一份声明中说:“这项研究揭示了在正常膀胱中突变和选择出人意料地丰富的景观,在一定程度上是由我们日常接触导致的个体间的巨大差异。”

使用靶向测序、外显子组测序和全基因组测序的组合,研究人员跟踪了近2100个膀胱微活检样本的体细胞突变,这些样本来自15个组织学正常的膀胱尿路病变健康个体和5个膀胱癌个体。他们的发现发表在科学周四,他揭示了膀胱中随着时间的推移会周期性突变的基因,同时提供了克隆选择和突变特征的研究。

作者报告说:“这项研究揭示了正常尿路上皮的突变过程和选择的丰富景观,在克隆和个体之间具有很大的异质性。”

基于1914个通过靶向测序评估的样本、655个外显子组测序的样本和88个通过全基因组测序评估的样本,研究团队强调了膀胱中17个基因的改变,这些基因似乎是在积极选择下发生的。与来自中老年参与者的正常膀胱样本相比,膀胱癌患者的基因突变更频繁,其中包括有助于染色质重塑途径的基因。

Martincorena说:“除了阐明癌症的起源和为早期检测工作提供信息外,这些观察结果还提出了关于这些广泛突变在衰老和其他疾病中的可能作用的问题。”

研究人员发现,在正常膀胱尿路上皮样本中选择的特定驱动基因在某种程度上与突变特征一样,因人而异。他们认为,这些差异可能反映了不同的环境暴露,特别是通过诱变或致癌化合物进入尿液。

尽管如此,结果确实揭示了在膀胱样本中过度代表的突变模式,包括来自APOBEC突变的突变签名。而且,研究小组解释说,更全面地描述在正常膀胱癌和膀胱癌样本中发现的体细胞变化,可能会提供一个机会,以发现膀胱正在走向疾病的个体。

桑格研究所和剑桥大学医院的癌症、衰老、突变和泌尿学研究员、合著者托马斯·米切尔在一份声明中说:“膀胱肿瘤中通常在正常组织中不存在的关键癌症基因突变的存在,为在尿液中存在的DNA片段中寻找这些变化提供了可能性。”“这些‘液体活检’可能是一种早期筛查膀胱癌的非侵入性方法,这可能有助于减少死于这种疾病的人数。”

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