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癌症基因组分析揭示了50岁以下患者肿瘤的独特特征

纽约——西奈山伊坎医学院的一个研究小组对年轻和年老的癌症患者进行了一项泛癌分析,结果显示,发生在50岁以下个体的一些癌症可能包含特定的肿瘤或微环境特征,这可能使他们更容易对特定的治疗类型产生反应。

资深通讯作者、西奈山伊坎医学院的遗传学和基因组科学研究员Kuan-lin Huang和他的同事们说:“这些发现突出了激酶抑制剂和免疫疗法可能针对的关键基因组和微环境改变,为年轻成人癌症患者提供了可能的治疗方案。写了细胞的报道周二。

在他们的分析中,研究人员考虑了来自癌症基因组图谱项目中14种癌症类型的6000多个病例的体细胞突变、拷贝数和染色体改变、DNA甲基化和免疫微环境特征。他们还对国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium)考虑的另外127例年轻发病病例和515例老年发病病例进行了验证测试。

通过比较1757年的特征确诊病例为50岁以下患者3608年在较晚确诊的个体中,他们缩小了驱动突变的范围,在较年轻的个体中确诊的18个基因中,驱动突变的比例似乎过高。

作者解释说:“青壮年癌症在全球范围内的发病率有所增加,但其分子病因仍不清楚。”作者指出,“尽管与晚发病例相比,青壮年肿瘤通常表现出较低的突变负担和相似的拷贝数变异谱,但它们在亚型特异性背景下的多重驱动突变和拷贝数改变丰富了。”

例如,在年轻组患者的皮肤黑色素瘤中,研究小组发现BRAF V600E驱动突变几乎是老年患者的两倍——在50岁以下患者的肿瘤中出现60.5%,在50岁以上患者的肿瘤中出现31.6%——这表明这些病例可能适合使用靶向BRAF药物进行治疗。

另一方面,BRAF突变在50岁以上患者的结肠癌中比在更早诊断出的结肠癌中更为常见,研究人员报告说。在那里,他们发现超过15%的老年人结肠腺癌病例中存在BRAF V600E,但在年轻人中仅超过2%。

即便如此,在年轻患者中发现的结肠腺癌肿瘤更容易包含PTEN基因的驱动突变,一些年轻患者的子宫肌体子宫内膜癌肿瘤也更容易出现ATRX和其他基因的突变。在年轻个体中,GATA3基因的体细胞变化与乳腺浸润性癌病例显著相关,而其他驱动基因突变在其他癌症类型的年轻患者中富集。

随着年轻组肿瘤中可疑的复制数、表达和甲基化差异,研究小组还看到了肿瘤免疫微环境模式,似乎与年龄一致,包括增强树突状细胞活性和tgf - β信号反应,以及较年轻患者肿瘤免疫微环境中较低的淋巴细胞浸润、巨噬细胞和干扰素- γ反应。

研究人员还探索了与年龄相关的肿瘤微环境特征与免疫治疗反应之间的潜在联系,因为来自老年患者的肿瘤往往有更多的单碱基突变和来自小插入和删除的新抗原。

根据使用免疫检查点抑制剂治疗的1500多例实体肿瘤病例的数据,他们发现了癌症类型之间的联系,包括头颈部鳞状癌、乳腺浸润性癌和结直肠腺癌病例,在年轻患者中显示生存率低、免疫细胞浸润水平低于正常水平和其他不良预后特征。

作者写道:“(肿瘤免疫微环境)在年轻人和老年人中的差异在组织中不同,这可能是积累的新抗原和年龄相关的免疫变化之间复杂相互作用的结果,需要进一步研究。”“这些差异可以决定患者的预后和免疫治疗的适用性。”

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