Ares Genetics是curretis公司成立两年的子公司,目前正在开发抗生素耐药性测试的计划中取得进展。该公司最近获得了建立一个研究项目的资金和新的实验室空间,在那里它将提供下一代基于测序的诊断服务和产品,它还开始与一家德国制药公司合作,利用其抗生素耐药性数据库进行药物开发。
Ares目前还在寻求美国风险资本进行a轮融资,旨在通过其位于圣地亚哥的美国中心或美国合作实验室,在欧洲提供抗菌素耐药性测试服务,并最终提供配套的分析。
Ares是总部位于德国Holzgerlingen的curretis的子公司,源于2017年Curetis从西门子手中收购的大型数据库。据curretis首席商务官兼Ares董事总经理Achim Plum说,该数据库最初包含超过1.1万种细菌菌株的DNA序列和21种抗生素的敏感性数据,Ares后来扩展了数据库。
Curetis本月早些时候宣布Ares启动了一个由维也纳商业机构共同资助的130万欧元(150万美元)的开发项目,一个支持者的维也纳Biocenter里面是阿瑞斯的办公室。这些资金用于一个名为“检测开发和人工智能诊断抗生素耐药性感染”的项目,被称为aaa级。
Ares抗性测试被称为通用病理基因组分析,或ARESupa。据该公司称,这是一种基于ngs的单一诊断测试,可以从任何类型的患者样本中检测出任何病原体和相关的耐药性。
Ares Genetics首席执行官Andreas Posch曾是西门子公司的研究科学家,他说,这个名为ARESdb的数据库“非常全面”地涵盖了抗性标记的基因型-表型关系。
然而,“抗生素耐药性在不断演变,这就是我们的人工智能方法发挥作用的地方,”Posch说。
Posch说,该公司设计了一种人工智能方法,利用内部生成的和从出版物中获得的序列信息来策划和扩展现有的数据库,以便“将所有新颖和新兴的标记快速转化为诊断解决方案”。
普拉姆指出,该公司能够对抗生素耐药性进行定量评估。具体来说,通过分析测序和其他数据以及其数据库,Ares可以提供全面的报告,将检测到的基因谱与细菌抗生素耐药性的阳性预测值联系起来。
虽然微生物培养后进行表型敏感性测试通常可以达到同样的目的,但通常这种方法需要几天或几周的时间,并且在合并感染和厌氧菌或其他不可培养的生物方面存在问题。
普莱姆说:“随着NGS的周转时间缩短,你真的有机会在更短的时间内为医生提供一个全面的可操作的图像。”
Posch强调,在从NGS数据中识别耐药性的内部研究中,该方法的准确率高达98%。“我认为这对临床医生来说是一个非常有价值的见解,”他说,特别是对于那些可能比培养更有周转时间优势的适应症和应用,比如严重的医院获得性感染和假体关节感染,但也不需要几个小时左右的极快周转时间。
例如,对于假体关节感染,指南建议进行两周的培养,以捕获容易导致这些感染的粘液状生物膜形成细菌。
“两周后,有时你的培养皿里只有一个菌落,你会想,‘那是我从实验室捕获的污染,还是真的?’”普拉姆说。在这种情况下,分子技术可能是检测病原体的唯一方法。
来自维也纳商业机构的新资金现在将支持参加在网上并在维也纳建立了一个名为ARESlab的专门的研发和诊断服务实验室空间,用于内部测试开发和在欧洲的初步商业化。
普拉姆说,该商业计划还需要在美国建立一个参考实验室,尽管这可能是它自己的实验室或合作伙伴的实验室。他说:“我们必须尽快让用户获得测试,但最终我们将计划将其转变为基于ivd的测试,这是一个更广泛的解决方案,数据生成更多地在本地完成,但解释将通过我们基于云的决策支持系统进行。”他说,该公司相信,参考实验室模式在美国得到了很好的证明,是一个重要的市场。
Plum进一步指出,许多制药公司正在退出新的抗生素开发,因为抗生素是“一种非常棘手的商业模式”,而且负担正在转移到诊断上,以充分利用现有的抗生素。
Ares最近宣布,它已开始与制药公司山德士(Sandoz)合作,开发一个使用ARESdb的数字平台,以支持重新利用现有抗生素,更好地治疗耐多药病原体感染。最终,这种合作还将涉及设计不太容易遇到耐药性的新抗生素。波施说,这次合作源于一个名为“数字微生物”的研发项目,该项目得到了奥地利研究促进局的支持。
重要的是,作为之前报道Curetis还预计,Ares的工作将导致新的独立产品,并为该公司基于pcr的多重分子诊断系统Unyvero添加遗传抗性标记。
Posch解释说:“你可以认为ARESdb既可以为curretis提供基于pcr的诊断,也可以为Ares提供基于ngs的测试和服务。”
Curetis的下呼吸道感染检测被称为Unyvero LRT面板,在样本到答案的工作流程中检测19种细菌和10种耐药性标记物。这是清除去年4月,美国食品和药物管理局批准了该测试系统。
Plum说:“我们获得了气管抽吸样本的初步许可,现在正在研究支气管平均样本的标签索赔扩展。”他指出,这一策略是在与FDA达成协议后设计的,目的是加快初步适应症的许可过程。
Plum说,该公司还有五种应用程序被CE-IVD标记,包括LRT面板、植入物和组织感染测试、血液培养盒、腹腔内感染测试和尿路感染测试。
普拉姆说,在美国,该公司于去年6月正式成立了LRT小组,到目前为止,已经开始与1000家目标医院中的140家的利益相关者进行深入对话。
他说:“我们有很多地方正在进行合同谈判,我们已经交付了第一批系统,我们有很多地方将开始对技术进行某种评估,研究工作流程的实现。”vwin德赢ac米兰合作他补充说,该公司计划很快就提供摄取的最新情况。
在美国,该公司计划将一种关节感染药筒作为其下一个产品。然而,“对于所有这些应用来说,这仍然是一个市场开发阶段,”他补充说,这似乎是分子微生物市场普遍存在的情况。
通过类比,普拉姆指出,15年前病理学刚刚开始接受分子技术,病理学家会说:“我用显微镜看不见的东西就不是真的。”
然而,现在在病理学中使用分子技术是标准的。他说:“我们在微生物学中也看到了同样的事情,它变得越来越分子化。”最终,这将补充微生物培养技术,但它也可以更快地提供一些结果,在某些情况下,可能是获得结果的唯一方法。
Plum还表示,在分子微生物市场中,多方利益相关者的方法尤其重要。
“让实验室主任相信一个系统的性能和好处是一回事……但你不能通过让微生物学家提供需求来创造需求;你需要与临床医生讨论临床益处,并与医院管理部门讨论如何帮助节省医院资金。”此外,特别是在美国,一个关键的利益相关者是抗生素管理团队。
普莱姆说:“这解释了为什么(分子微生物学的)销售周期相当长,因为你需要让所有的利益相关者都参与进来,但这对我们所处的住院治疗领域的任何其他解决方案都是如此。”
最后,特别是对于耐药标记物,有时需要在医生使用测试产生的信息之前进行教育,Plum指出。
为此,Ares团队为univero面板上的标记物开发了一个直观的、基于网络的交互式知识库,该公司打算很快提供给临床医生。通过这种方式,他们可以输入他们在Unyvero中找到的标记名称,他们将从ARESdb中获得所有信息。普莱姆说:“他们得到了所有的见解……所以他们掌握了所有关于标记的知识,以及临床意义。”