纽约-根据布罗德研究所、波士顿儿童医院、哈佛医学院和其他地方的研究人员的新研究，引入罕见的遗传风险变异数据有可能改善2型糖尿病(T2D)的多基因风险评分(PGS)的表现。
“我们的研究结果表明，在复杂的pga性状中添加罕见变异将是有价值的，尽管通过多基因效应，与早期预测罕见变异对常见疾病有高度影响的多基因效应完全不同，”共同资深和通讯作者Jason Flannick和他的同事，他是Broad、哈佛、波士顿儿童医院和AMP-T2D-GENES联盟的研究人员写了在自然遗传学周一。
研究人员使用超过87,700名来自欧洲、西班牙、非洲裔美国人、东亚或南亚血统的英国生物银行或AMP-T2D-GENES研究参与者的外显子组序列数据，寻找与T2D相关血糖特征(称为血红蛋白A1C (HbA1C))相关的个体变异或基因，这是诊断T2D的常用指标。
作者解释说:“糖化血红蛋白受常见遗传变异的影响，这些遗传变异既影响血糖控制的核心途径，也影响红细胞特性(如细胞寿命)的途径。”作者指出，“红血病变异不影响T2D的风险，事实上，通过改变测量的糖化血红蛋白和真实血糖水平之间的预期关系，可以导致糖尿病误诊。”
研究小组强调了HbA1C与30多种中等或高影响变异的显著相关性，以及在PIEZO1、GCK和G6PD基因中过度表达的罕见变异。这些和其他红细胞功能相关基因PIEZO1和G6PD的罕见变异似乎会影响用于诊断T2D的HbA1C水平，以及基于常见遗传变异的现有T2D PGS的性能。
扩大他们的观点，包括在关联分析中与HbA1C或在先前基于外显子组测序的分析中与T2D联系更微弱的可疑罕见变异，研究人员将几个罕见的基于变异的PGS放在一起，确定了一个拟议的T2D PGS，包括涵盖150多个基因的近21,300个变异。这组基因主要由在他们考虑的三个或更少的个体中出现的超罕见变异组成。
虽然罕见变异的糖尿病PGS显示出预测T2D的希望，但研究小组发现，将罕见和常见的PGS结合起来用于T2D的方法具有更好的准确性。该小组估计，仅在美国，合并后的PGS就可以重新分类约490万例误诊的T2D病例，相比之下，常见变异PGS的重新分类为340万例，由罕见变异PGS组成的重新分类为240万例。
作者写道:“这些结果表明，尽管罕见变异对复杂性状的影响相对较小，但可能对复杂疾病的基于基因的诊断策略有意义。”作者指出，目前的发现“提供了一种从罕见变异构建复杂性状pgs的方法，并表明罕见变异将增强常见疾病精准医疗方法中的常见变异。”