来自瑞典和中国的一个团队开发了弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的单细胞转录组图谱，揭示了DLBCL病例内部和跨细胞表达的异质性，肿瘤与免疫细胞和其他微环境细胞的相互作用，以及影响肿瘤生物学的特征，包括乙肝病毒(HBV)感染。
“[W]e表明，恶性和非恶性细胞的发展轨迹、恶性和肿瘤浸润细胞之间的相互作用以及慢性病毒感染的影响可以进一步解释DLBCL的疾病异质性。”共同高级、通讯作者潘强Hammarstro米这是卡罗林斯卡学院(Karolinska Institute)的一项生物科学和营养研究他指出，“进一步研究已确定的恶性细胞亚群的体细胞突变概况和药物反应，可能为疾病机制和治疗策略提供更多的见解。”
正如他们在细胞的报道周二，研究人员对来自17例DLBCL病例的超过94,400个单个细胞进行了基于液滴的单细胞RNA测序，分析了单细胞转录组数据以及全基因组序列和大体积RNA序列数据。他们还将这些发现与来自三个不相关的个体(Burkitt淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤或反应性淋巴样增生)的肿瘤样本的基因表达特征进行了对比。
作者解释说:“通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)方法，我们创建了DLBCL中恶性和非恶性细胞的综合细胞图谱，这也使我们能够在单细胞水平上研究慢性HBV感染对淋巴瘤发生的影响。”
在恶性DLBCL细胞中，研究小组发现了73种不同的基因表达模式，包括8种似乎出现在考虑的样本中的表达程序。每个样本包含2到7个不同的基因表达模式，为DLBCL治疗反应、复发和结果的表达和信号转导模式提供线索。
同时，在肿瘤微环境中，研究人员强调了8个B细胞簇，16个T细胞簇和6个髓细胞簇。当他们深入研究肿瘤细胞和微环境特征之间的相互作用时，利用图谱中近2800个细胞-细胞相互作用预测，研究人员看到了微环境信号，似乎促进了肿瘤细胞存活，并确定了与T细胞免疫衰竭相关的抑制T细胞特征。
“因为B细胞淋巴瘤的正常对应物也是免疫系统的一部分，”作者解释说，“因此，与其他实体肿瘤相比，在[肿瘤微环境]中恶性细胞、浸润的T细胞和其他免疫细胞之间的相互作用更复杂。”
在HBV感染标记的样本子集中，研究小组发现基因表达变化涉及主要组织相容性复合体II类、干扰素- γ免疫活性和其他基因，这些基因似乎改变了这些病例中的肿瘤相互作用和结果，尽管在HBV阳性和无HBV形式的DLBCL中有类似的非恶性细胞组成。
“总的来说，结果表明HBV感染可能对恶性和非恶性细胞都有显著影响，而且，一般来说，[肿瘤微环境]在HBV阳性DLBCL患者中更具有免疫抑制作用，”作者报告说。“因为据报道，目前一线免疫化疗对hbv阳性DLBCL患者的反应较差，我们的结果可能为这组患者的替代治疗策略的临床试验提供分子证据，如将抗pd -1或抗ctla与其他免疫检查点抑制剂结合。”