佛罗里达州奥兰多市- - - - - -染色质构象捕获检测开发商燕尾基因组公司(Dovetail Genomics)与提供宏基因组微生物检测技术的兄弟公司Arc Bio联合成立了Cantata Bio。vwin德赢ac米兰合作
除了宣布合并,Cantata还推出了一种新的基于Tn5转座酶的近距离结扎检测方法TopoLink在本周的基因组生物学与技术进展年会上,该公司表示,样品准备时间从两天缩短到六vwin德赢ac米兰合作个小时。TopoLink产品面向研究人员进行循环调用,检测基因组中的染色质循环。
Hi-C是一种基于染色体构象或三维基因组结构的测序方法。各种Hi-C方法将基因组的不同片段(或宏基因组学中不同基因组的片段)连接起来,在这些区域之间提供所谓的“长范围”连接,这超过了通过测序获得的读取长度,特别是在短读取平台上,如Illumina。Hi-C数据的早期应用包括植物和动物基因组组装,其中接触图有助于改善contigs。
其他提供Hi-C检测的公司包括Arima Genomics和Phase Genomics。Arima Genomics是任冰在加州大学圣地亚哥分校实验室的分支机构。
Cantata Bio的成立将两家公司合并在一起,首席执行官托德·迪金森(Todd Dickinson)在过去七年里一直领导着这两家公司。他是董事会成员的EdenRoc科学公司是这两家公司的母公司。康塔塔生物将有三个业务部门:表观遗传学和基因组结构、微生物分析和遗传分析解决方案。VWIN娱乐网站前两个部分或多或少分别对应于旧的Dovetail和Arc业务。第三个是结构重排检测和单倍分型,Dickinson预测这将是一个增长领域,并补充说该公司“非常有兴趣与制药公司合作”。
这些制药公司的一些客户帮助萌生了一个想法,最终促成了合并。他说:“我们看到了异受精,我们可能会与一家癌症公司交谈,他们对染色质构象变化或与癌症早期检测相关的特征非常感兴趣,他们也会对微生物分析表现出兴趣。”
“我们年代注意到我们的客户是重叠的,”他补充道。“有一次,我通过Dovetail电话与一位客户会面,我发现自己说,‘你听说过我的另一家公司吗?’”
此次合并为公司带来了运营效率,并为客户提供了更大的分析目录。迪金森说,公司“解雇了几个人”,但他指出,公司计划在其他领域招聘更多员工。他拒绝提供有关公司收入的信息。
TopoLink
Cantata的第一个产品是TopoLink,它帮助公司摆脱使用序列基元来分割DNA的限制性内切酶。
Cantata市场总监Iain Russell说,这有助于提供更高的覆盖一致性,并同时提供下一代测序库准备标签。
他说:“一步就能提供这些标签以及碎片化是我们如何将两天的检测缩短到6小时的关键。”
Cantata设计的试剂盒简化了循环调用的样品准备,这需要高测序深度,因此每个样品有多个库。Russell说,使用TopoLink,单个近距离连接反应可以创建四个测序库,而以前客户可能必须运行四个反应才能创建八个测序库。他补充说:“它既更快,又减少了你必须进行的反应数量,以获得所需的深度测序。”
这款产品尚未发布,狄金森拒绝就定价置评。罗素建议,这种方法的总成本可以是其他方法的一半。康塔塔正在接受订单,并计划在7月发货。它已经联系了早期采用者,允许他们使用第一批工具包。