纽约(基因组网)-一个中国研究团队已经锁定了一种肿瘤基因表达特征，该特征似乎可以区分胶质母细胞瘤患者的总生存时间是好是坏，而独立于其他潜在的预后预测因素，如治疗类型。
河南大学淮河医院和郑州铁路职业技术学院的研究人员收集了癌症基因组图谱(TCGA)和中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)项目评估的数百种胶质母细胞瘤肿瘤的RNA序列数据集，寻找与患者生存时间或其他临床结果相关的基因表达签名。当他们报道在科学报告今天，他们的研究导致了6个基因的预后风险评分，在验证队列中区分高风险和低风险胶质母细胞瘤病例。
河南大学淮河医院转化医学、感染和免疫研究员左曙光及其合著者写道:“多变量和分层分析表明，该基因面板独立于其他临床和病理特征，因此是胶质母细胞瘤潜在的预后生物标志物。”
研究小组指出，中枢神经系统肿瘤胶质母细胞瘤不仅具有侵袭性，而且具有临床和分子异质性，即使在具有类似组织病理学特征的病例中也是如此。这促使人们对识别与生存率、治疗反应或耐药性以及其他临床特征相对应的标记产生了兴趣，从而为治疗策略提供信息并改善患者预后。
作者解释说:“一个可靠的基因组预后特征可以补充传统的临床预后因素，并进一步实现个性化治疗。”
在他们的分析中，研究人员考虑了158例TCGA胶质母细胞瘤病例(102例男性和56例女性)的Illumina RNA测序数据，以及通过CGGA评估的137例中国个体(90名男性和47名女性)的胶质母细胞瘤，重点关注分别在TCGA和CGGA队列中通过筛选步骤的22,884个基因和28,504个基因的表达。
该团队最初的顺序单变量和逐步多变量Cox分析突出了TCGA队列中的17个基因预后模型和CGGA队列中类似模型中的12个基因。基于CD79B、MAP2K3、IMPDH1、SLC16A3、MPZL3和APOBR基因的表达，从两个队列中具有信息表达谱的基因中，研究小组确定了一个六基因预后模型。
当研究小组评估TCGA和CGGA验证队列中的6个基因签名时，发现存活时间较短的高危病例中，相对于TCGA和CGGA组中风险较低的病例，所有6个基因的表达都显著上升。
同样，高风险和低风险表达谱将接受放疗的TCGA胶质母细胞瘤患者，以及接受放疗或化疗的CGGA患者的总生存时间较好或较差的患者区分开来，尽管风险分层在CGGA病例中表现最为明显。
研究人员注意到，与其他临床特征相比，6个基因表达特征显示出与胶质母细胞瘤患者预后的独立联系，治疗类型和MGMT单基因表达也是如此。他们的初步发现表明，新的风险评分可以区分原发性和继发性胶质母细胞瘤的高风险和低风险病例，尽管它没有显示出与复发性疾病个体的生存有显著联系。
作者指出，尽管过去基于表达的预后特征的所有6个基因都与胶质母细胞瘤和/或其他癌症类型的发生或进展有关，但新的结果指出，这些基因的联合表达“可能被视为一种新的危险因素，可能作为胶质母细胞瘤患者的预后指标。”