纽约(GenomeWeb)——葛兰素史克(GSK)和Regeneron制药公司宣布与英国生物库合作开展一项新的研究计划,对英国生物库约50万名志愿者的基因组进行测序。
Regeneron的全资子公司Regeneron遗传学中心将负责测序工作。Regeneron和GSK已承诺,将在今年年底前对首批5万个样本进行测序,具体资金数额不详。该组织表示,对剩下的样本进行测序将需要三到五年的时间。研资局指出,该局每年可为15万人进行基因测序。
在初始测序阶段之后,Regeneron和GSK将在9个月内独家获得测序数据,之后将纳入英国生物银行的资源。这两家公司表示,他们将把这项研究成果提交给同行评议期刊。
牛津大学教授、英国生物库首席研究员罗里·柯林斯在一份声明中表示:“GSK和Regeneron的初始投资将极大地提升英国生物库资源的价值,为世界各地研究许多不同条件的学术和行业研究人员提供资源。”“这一令人兴奋的举措有望在今年迅速产生新的发现,并将使英国生物银行对健康相关的研究更加有用。”
他指出,对所有样本进行测序大约需要1.5亿美元。
使用的测序技术和基因组覆盖率都vwin德赢ac米兰合作没有具体说明。然而,在今天给投资者的一份报告中,Evercore ISI的分析师Ross Muken表示,Regeneron是最早的采用者之一Illumina公司推出了NovaSeq仪器1月。
他说,该项目可能被证明是“Illumina的一个增量积极因素,并突出了NovaSeq的好处。”
Illumina表示,NovaSeq最终可以以100美元的价格进行基因组测序;他说,根据英国生物银行项目1.5亿美元的估算,每个基因组的成本约为300美元。
他写道:“这一消息让我们对我们的NovaSeq放置估计有信心(2017年为235个),因为我们估计,如果该项目在NovaSeq上运行,该项目可能会导致额外购买20个NovaSeq,(我们估计每个NovaSeq每年可以产生约4800个整个人类基因组,30倍覆盖- 4800 x 20到30盒x 5年= 500k样本)。”
该项目也在2016年11月完成Regeneron和西奈山医疗系统之间的协议对来自BioMe生物库的样本进行全外显子组测序。英国生物银行也签署了类似协议2013年与Affymetrix达成合作协议对储存库中的50万人进行基因分型。