来自华盛顿大学太平洋西北国家实验室和其他地方的一个团队已经在胶质母细胞瘤(GBM)中确定了免疫亚群，这可能最终有助于开发更有效的免疫治疗方法来对抗侵袭性脑癌。
“要改进这种致命癌症的治疗方法，了解肿瘤细胞本身很重要，但还不够，”华盛顿大学的医学和遗传学研究员、肿瘤部门计算生物学主任、麦克唐奈基因组研究所助理主任李丁(音译)在一份声明中说。“我们还必须了解肿瘤细胞与周围环境的相互作用，包括免疫细胞、结缔组织和血管。”
考虑到这一点，研究人员使用全基因组测序、外基因组测序、RNA测序、微RNA-seq、单核RNA-seq、基于阵列的甲基化分析、质谱和其他方法来评估99例未治疗的GBM肿瘤和10例正常、不匹配的大脑样本的基因组、代谢组学、蛋白质组学和翻译后修饰模式。他们的发现发表在癌症细胞周四，他指出了神经系统癌症的四种GBM免疫亚型，包括一种富含IDH突变肿瘤的免疫亚型。
这些发现“可能对临床试验和治疗的患者分层有潜在的意义，”丁在一封电子邮件中解释道。
例如，其中一种免疫亚型以缺乏T细胞和大量浸润的巨噬细胞免疫细胞为标志，而另一种免疫亚型富集了T淋巴细胞和自然杀伤细胞水平以及IDH突变，但在巨噬细胞-小胶质细胞免疫细胞浸润方面较差。研究小组指出，另一种免疫亚型具有中等水平的巨噬细胞，而第四种免疫亚型总体上缺乏显著水平的免疫细胞。
研究人员推测，考虑到这些不同的亚型可能会刺激对神经系统癌症更有效的基于免疫系统的治疗，同时使区分预期对免疫治疗有更好或更差反应的病例成为可能。
华盛顿大学神经外科研究员、西特曼癌症中心脑肿瘤中心主任阿尔伯特·金(Albert Kim)在一份声明中说:“到目前为止，胶质母细胞瘤的免疫治疗临床试验一直是阴性的。”“事实上，有四个不同的免疫亚群可能是背后的原因之一。我们不能把所有的胶质母细胞瘤都当作一种疾病来治疗。”
除了免疫亚型的发现之外，该团队的分析还揭示了一系列有价值的GBM特征——从DNA修复途径活性的变化和潜在的靶向致癌途径到组蛋白乙酰化和磷酸化转变，包括涉及PTPN11和PLCG1基因产物的高于正常水平的磷酸化。
“多维分析……为之前基于基因组和转录的GBM研究增加了背景，”作者报告说，“并为进一步的机制研究提供了途径。”
丁宁指出，研究人员目前正在对他们目前的发现进行后续研究，该研究涵盖了更广泛的GBM患者，包括年轻的GBM患者和复发性GBM患者。
“单细胞基因组学和蛋白质组学技术的快速发展将促进GBM异质性和[肿瘤微环境]相互作用的更深入分析，”丁和她的合著者总结道。“我们希望这些进展将改善临床试验中的患者分层，并最终导致个性化治疗。”