旧金山(GenomeWeb) - Grail本周表示,它将与伦敦大学学院和伦敦大学学院医院NHS基金会信托合作,开始一项新的早期癌症检测临床研究。这项研究旨在招募5万人,其中一半人因有吸烟史而有患肺癌的风险。
Grail临床开发副总裁安妮-蕾妮·哈特曼(Anne-Renee Hartman)表示,虽然这项被称为“峰会”(Summit)的研究将专注于肺癌的早期检测,但它将支持Grail的多种癌症早期检测测试的开发,而不是单独的肺癌测试。
在本周的一次采访中,该公司还讨论了在香港推出鼻咽癌早期检测测试的计划,并提供了其开发多种癌症早期检测测试的最新战略。该公司目前正在三种测序策略中进行选择,并将验证其选择的一种:靶向测序、全基因组测序或全基因组亚硫酸氢盐测序。Grail负责企业事务的副总裁夏洛特·阿诺德(Charlotte Arnold)表示,无论该公司最终决定采用何种方法,Summit的研究都将被采用。
在Summit研究中,Grail将在英国招募5万名年龄在50岁至77岁之间、没有癌症的男性和女性。根据吸烟史,一半的队列将被认为是肺癌的高风险人群,并将通过低剂量计算机断层扫描(LDCT)进行筛查。此外,他们还将获得戒烟资源。
哈特曼说:“这将使我们能够将我们的测试与LDCT筛查的性能进行比较。”在美国,LDCT是一种推荐的筛查测试,用于因吸烟史而患有癌症的高风险人群,但在英国,它并没有被广泛使用作为筛查工具。因此,哈特曼说,英国团队的一个目标是评估LDCT用于肺癌筛查,以及支持Grail公司的无细胞DNA测序测试的发展。
哈特曼说,研究小组计划在2019年开始招募患者,但目前还没有完成这项研究的时间表。哈特曼说,NHS有一个电子机制来识别有资格参加这项研究的个人,并通过他们的全科医生与他们联系,以及一个具有重要临床数据的国家癌症登记处。她说:“这是一种有效的方法来锁定和招募参与者,然后收集我们需要的数据,以证明我们的测试可以发现癌症。”
该研究的参与者将在注册时提供血液样本,然后在三年内每年提供一次。
虽然Summit研究的重点是有肺癌风险的个体,但这些数据将用于进一步开发Grail的多癌细胞无DNA测序测试,而不是单独的肺癌检测。
事实上,圣杯今年早些时候哈特曼说,该公司计划根据正在进行的另一项名为Strive的研究结果,开发至少一种乳腺癌特异性检测方法,此后决定专注于开发一种多种癌症筛查方法。
Grail仍在推进其“奋斗”研究,最近完成了对10万名女性的登记。但是,随着其循环细胞无基因组图谱研究(CCGA)的中期数据的出现,该研究在今年的国际生物医学大会上发表美国临床肿瘤学会,美国癌症研究协会哈特曼说,在美国和欧洲医学肿瘤学会(European Society of Medical Oncology)的会议上,该公司决定将Strive研究“转向”支持开发一种多种癌症的检测,而不是针对乳腺癌的检测。
阿诺德解释说,圣杯在今年的会议上展示的CCGA数据包括其工作的“发现阶段”。为此,Grail使用了三种原型分析方法——靶向、全基因组和亚硫酸氢盐测序——来分析来自2800名癌症患者和非癌症患者的样本。
阿诺德说,发现阶段的一个重要发现是Grail测试的假阳性率很低。在一组早期结果中,948人中有8人收到了“类似癌症的信号”,尽管他们没有患癌症。然而,自从最初报告的结果似乎是假阳性以来,其中三名患者已经被诊断出患有癌症,“这表明我们在这三人身上看到的信号表明存在未确诊的癌症,假阳性率可能更低,”她补充说。该公司还在继续跟踪其余5人,以确定他们的结果是否真的是假阳性。
Arnold说,Grail的另一个第一步是证明它可以在已知患有癌症的个体中识别癌症。在会议上公布的数据中,该公司发现肺癌、结直肠癌、食管癌、头颈癌、肝癌、卵巢癌、胰腺癌和某些侵袭性乳腺癌,以及淋巴瘤和多发性骨髓瘤的强烈信号。
“我们的下一步是优化我们的分析和机器学习算法,”阿诺德说。该公司还将最终确定将在CCGA研究的更大数据集上进一步开发和验证三种检测方法中的哪一种。
哈特曼说,由于改变了“奋斗”研究的目标,该公司能够将需要招募的总人数从12万人减少到10万人。这是因为它可以利用来自CCGA研究的发现队列,并将使用Strive队列用于验证目的。
对于Strive, Grail一直在招募接受常规乳房x光检查的非癌症女性。参与的女性会向Grail捐献血液样本。研究人员将对这些女性进行为期一年的临床跟踪,Grail将对任何患有乳腺癌或其他类型癌症的患者的血液样本进行无细胞DNA测序。在癌症诊断时,Grail将收集第二份血液样本进行测序。此外,该公司还将分析来自未患癌症的对照组的血液样本,以确保在无细胞DNA中看到的癌症信号不会在未患癌症的女性身上检测到。
另外,Grail一直在与香港中文大学Dennis Lo的实验室合作进行鼻咽癌(NPC)的筛查试验。Lo之前创立了液体活检初创公司Cirina, Grail收购了去年。
Grail曾计划在今年年底前,根据一项研究的结果,在香港开展一项NPC早期检测测试20000人的研究证明了使用Epstein Barr病毒PCR检测在无症状个体中筛查鼻咽癌的可行性。但在今年早些时候发表的一项研究中,罗的团队表明,无细胞DNA测序的方法根据大小和末端核苷酸的差异,将癌症来源的无细胞DNA片段与正常DNA片段区分开来,极大地提高了测试的性能。因此,Arnold说,Grail决定修改商业测试以利用性能的提高,并推迟了它的发布,以整合这些更新并验证测试。她没有提供最新的时间表。如前所述,Grail计划首先在香港开展测试,然后是东南亚其他地区,这些地区的NPC患病率高于世界其他地区,每10万人中有35例。
Arnold拒绝详细说明Grail决定在香港和东南亚推出NPC测试是否意味着该地区的商业方式有所不同,但他表示,该公司将制定全球商业战略,稍后将提供更多细节。该地区主要是自费市场。“亚洲占全球癌症负担的一半,”她说,“我们相信,该地区对早期癌症筛查检测产品有巨大需求,包括我们的多种癌症早期检测测试。”
早期癌症检测正在迅速发展。例如,CellMax Life已经在亚洲提供了一种基于循环肿瘤细胞的结直肠癌筛查测试,并开始了一项研究临床试验今年早些时候在美国上市,目标是将其提交给美国食品和药物管理局。
还有新来者Singlera Genomics提出了数据在10月份的美国人类遗传学学会会议上发表了一项基于10万名成年人样本的回顾性研究。这家初创公司正在开发一种基于甲基化分析的无细胞DNA测序测试。Freenome也是如此展示数据在无细胞dna癌症筛查测试的会议上。