纽约-由Decode Genetics的Kari Stefansson领导的冰岛研究人员对该国感染SARS-CoV-2风险最高的人群进行了测序和人群筛查,发现10岁以下儿童和女性的感染发病率低于青少年或成人和男性。
研究人员写道星期二在他们的研究中新英格兰医学杂志2月底,冰岛首次诊断出COVID-19,但关于导致该疾病的SARS-CoV-2病毒如何进入人群并在人群中传播的数据有限。为了阐明其在冰岛的传播,Stefansson和他的同事测试了9199名居住在该国的人,这些人有症状,最近去过高风险国家,或与感染者有过接触,因为他们是最高风险的人。他们从643个样本中测序了SARS-CoV-2。
研究人员还以两种方式进行了人口筛查。他们向10797人发出了公开邀请,还随机邀请了2283人来参加测试。
研究人员发现,在被招募的定向方法中,共有1221人(13.3%)的SARS-CoV-2检测呈阳性。在接受测试的普通人群中,公开邀请筛查的87人(0.8%)和随机人群筛查的13人(0.6%)病毒检测呈阳性。总共有6%的人接受了筛查。
“与10岁或以上的人相比,10岁以下儿童获得阳性结果的可能性更低,定向检测的比例分别为6.7%和13.7%;在人口筛查中,10岁以下的儿童没有阳性结果,而10岁或以上的儿童有0.8%的阳性结果,”作者写道。“在定向检测(11% vs. 16.7%)和人群筛查(0.6% vs. 0.9%)中,获得阳性结果的女性都比男性少。”
他们还指出,测序的SARS-CoV-2病毒的单倍型是多样的,并且随着时间的推移而变化,但通过人群筛查确定的受感染参与者的百分比在筛查的20天期间保持稳定,这与遏制措施的有益效果是一致的。
在早期的定向检测中,65%的SARS-CoV-2检测呈阳性的参与者最近都去过冰岛以外的地方。研究人员发现,在后期,15.5%的人最近去过国外。同样,他们指出,在研究期间,参加人口筛查和最近出国旅行的参与者比例也迅速下降。
在早期定向检测阶段检测结果呈阳性且有旅行经历的参与者中,86.1%的人在2月底之前去过被指定为高危地区的地区,如中国和奥地利、意大利和瑞士的阿尔卑斯山区。然而,研究人员还发现,在筛查组的87名测试呈阳性的参与者中,有12人最近去过英国,这表明病毒在英国人群中传播相对较早。
在对从643个样本中提取的SARS-CoV-2 RNA进行测序时,研究人员从581个样本中获得了病毒基因组的90%以上的覆盖率,从605个样本中获得了67%以上的覆盖率。他们称其为409个序列变体,其中291个在GISAID数据库中没有找到。为了进一步阐明冰岛居民中SARS-CoV-2感染的地理起源,他们生成了一个包含1547个完整病毒序列的中位连接网络,其中513个来自冰岛人的完整病毒基因组,1034个来自世界各地的其他人群。
在研究人员在早期靶向测试中获得的157个测序病毒粒子中,他们发现143个位于A2分支中。虽然A和B单倍型在东亚很常见,但B1a单倍型是美国西海岸爆发疫情的中心,A2a及其后代几乎只在欧洲人群中发现。
然而,从早期靶向检测到后期靶向检测,单倍型的组成发生了重大变化,早期靶向检测中157个单倍型中有103个是A2a1和A2a2单倍型,后期靶向检测中361个单倍型中有115个是A2a1和A2a2单倍型。研究人员说,A1a和其他a2a衍生的单倍型的频率增加,很可能是因为人口筛查已经确定了来自英国等未被指定为高风险地区的感染人群。
“A2a3a和A2a2a单倍型是冰岛最常见的两种单倍型;在577名提供测序样本的人中,78人(13.5%)发现了A2a3a单倍型,45人(7.8%)发现了A2a2a单倍型。”
研究人员得出的结论是,从3月13日到4月1日,冰岛总人口中SARS-CoV-2感染的频率保持稳定,这似乎表明该国实施的遏制措施正在发挥作用。
“然而,”他们补充说,“病毒已经传播到这样的程度,除非我们继续检测和隔离,追踪接触者和隔离,否则我们很可能无法控制病毒。”