纽约——根据一项新的研究，尽管非裔美国人和欧洲裔美国人之间有一些相同的风险基因和等位基因，但非裔美国人炎症性肠病(IBD)背后的基因结构似乎与欧洲裔美国人不同。
埃默里大学医学院的儿科学和人类遗传学教授、亚特兰大儿童保健中心的研究人员Subra Kugathasan和他的同事写道:“细微的差异影响多基因风险评分的表现，我们表明，在风险最高的百分位中，与祖先相适应的权重显著提高了多基因预测。”
当他们报道在美国人类遗传学杂志周三，埃默里大学、罗格斯大学、佐治亚理工学院和其他地方的研究人员对近1800名患有IBD的非裔美国人和1600多名来自美国的非裔血统的未受影响的对照组的基因组进行了测序。vwin德赢ac米兰合作
虽然该团队的研究没有发现与IBD有全基因组显著联系的新基因座，但基因组序列数据和后续的精细绘图分析表明，与欧洲血统的个体相比，在非裔美国参与者中，几个风险等位基因以不同的频率出现，或具有不同的影响大小。
Kugathasan在一封电子邮件中解释说，研究结果还强调了在设计IBD多基因风险评分时考虑祖先因素的重要性，称该研究是“如何在多基因分析中考虑祖先因素的一个例子”。
除了报告IBD PRS的表现受祖先影响外，他和他的同事们还证明，考虑到种群间等位基因差异的“加权”PRS可以改善风险预测。
“我们的分析……提供了一个例子，说明在考虑医疗保健中的种族差异时，多基因分析需要如何根据祖先进行调整，”作者报告说，并指出“PRSs的频率分布在人群中可能显著不同，这主要是因为等位基因频率的偏差，尽管在发现共同变异关联时的确定偏差也是一个问题。”
通过1335例克罗恩病患者、407例溃疡性结肠炎患者、32例炎症性肠病未知型(IBDU)患者和1644例非炎症性肠病患者的基因组序列数据，研究小组追踪了超过9000万例常见、低频或罕见的变异。
Kugathasan指出，大规模的研究使得排除了在解释之前在IBD中描述的缺失遗传性方面仅由罕见变异所起的作用成为可能，同时帮助梳理出研究中包括的非裔美国人个体中独特的IBD相关等位基因结构。
该团队随后的精细绘图分析表明，PTGER4基因与非裔美国人的克罗恩病风险有很大关系，尽管该位点的特定风险snp与欧洲人克罗恩病风险中描述的不同。相反，在欧洲血统的克罗恩病个体中，NOD2和IL23R基因与非裔美国参与者的克罗恩病没有显示出显著的联系。
与此同时，当他们专注于罕见的变异时，研究人员在溃疡性结肠炎个体中发现钙结合神经免疫调节剂基因CALB2的富集。这一组包括了似乎专属于非洲血统个体的变异，但作者指出，“这一发现需要谨慎解读，因为在独立队列中缺乏复制或功能验证。”
作者总结道:“有必要进一步研究导致祖先特异性效应的机制，包括评估相关罕见变异的影响，累积的遗传背景修饰因子，以及基因型-环境相互作用。”