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LabCorp进军基于ngs的肿瘤市场,基础药物增加血液学癌症检测

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美国实验室公司本周,该公司推出了用于肿瘤分析的50个基因癌症面板,进入了下一代肿瘤测序市场,而Foundation Medicine上周发布了用于血液癌症的405个基因面板,扩大了其检测菜单。

LabCorp的IntelliGen检测方法涵盖了50个致癌基因或肿瘤抑制基因中的大约2600个突变,并将通过该公司的专业实验室之一集成肿瘤学提供。

根据该公司的说法,虽然小组中包含的基因列表无法立即获得,但它包含了已知对癌症的发生、进展和治疗非常重要的基因,包括“可能指导治疗决策的成熟生物标志物”。

LabCorp表示,癌症治疗最近已经转向针对肿瘤特定基因组改变的生物药物,这需要新的测试。这些测试需要提供“更多具有诊断意义的信息”,并正确识别早期检测到的肿瘤小样本中的突变,包括仅在样本的一小部分中存在的突变。该公司表示:“LabCorp的NGS平台满足了这两个需求。”

LabCorp说,当指南推荐的生物标志物评估没有治疗选择时,新的测试可能是有用的;当肿瘤进展,患者在治疗后复发;当肿瘤分化程度低且来源不确定时;诊断时没有有效的标准治疗;当根据指南对组织进行生物标志物评估是有限的;或者什么时候对未来的临床试验广泛地描绘潜在的基因靶点是有用的。

LabCorp没有立即回应有关该检测方法的更多信息的请求,但在该公司10月份的第三季度收益电话会议上,首席执行官兼总裁大卫·金提供了更多细节。

根据King的说法,IntelliGen的主要用途是实体瘤,尽管它在白血病和淋巴瘤中也有“一些特殊应用”。

他当时拒绝提供价格信息,指出公司正在与付款人讨论价格。

他说,在接下来的几个季度里,LabCorp将提供“更全面的肿瘤学小组”,包括液体肿瘤、基因重排、预后和预测标记的额外内容。此外,该公司还将提供更有针对性的检测,包括针对Lynch综合征的检测,Lynch综合征是一种遗传性疾病,会增加患结肠直肠癌的风险。

金说,在第一个肿瘤学小组中,该公司“关注的不是我们可以测试的最广泛的范围”,而是“需要研究的关键基因”。

“这将是我们的首次发布,”他说。“我们将继续增加内容和服务。”

IntelliGen并不是LabCorp第一个进入下一代基于测序的诊断领域。今年2月,该公司推出了GeneSeq Cardio,这是其首个基于ngs的检测方法,用于评估与遗传性心脏病相关的许多基因突变。

LabCorp在肿瘤下一代测序领域的主要竞争对手之一将是Foundation Medicine,该公司完全专注于基于ngs的体细胞癌症检测。

今年早些时候,该公司推出了FoundationOne,这是一种基于ngs的实体肿瘤检测方法,包括大约240个癌症相关基因和一些内含子,并在10月份发表了一份关于该测试的分析验证研究。

超过2500人在第三季度,肿瘤学家订购了其中的检测方法,该测试在该季度从临床客户那里获得了大约440万美元的收入。第三方付款人每次测试的平均报销金额约为3,300美元,因此本季度约有1,300项测试为临床收入做出了贡献。

该公司于去年9月上市,上周推出了第二款基于nns的检测产品FoundationOne Heme,用于血液病癌症、某些肉瘤和儿童癌症。

在过去的七个月里,该公司与纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究人员合作开发了这项测试。FoundationOne血红素结合靶向DNA测序和RNA-seq。

它对405个癌症相关基因进行了测序,涵盖了所有类型的基因组改变,包括单碱基替换、插入和删除、拷贝数改变和选择基因重排。

此外,该测试将RNA-seq应用于265个基因,以评估这些基因中的基因融合,这是血液癌症、肉瘤和儿科癌症中常见的驱动突变。

基础医学表示,MSKCC的研究人员在400多个患者样本上验证了测试的准确性和性能,该公司及其合作者将在本周的美国血液学学会年会上展示10项研究的测试数据。

LabCorp和Foundation Medicine的NGS检测都在与各个癌症中心和其他临床实验室内部开发的癌症检测小组竞争,这些小组得到了用于靶向扩增癌症基因的下一代测序平台供应商的工具包的帮助。

例如,Illumina公司的TruSeq扩增子癌症面板针对48个癌症基因中的212个扩增子和热点区域,并针对其MiSeq系统进行了优化,而Life Technologies公司用于PGM的Ion AmpliSeq癌症热点面板v2包括来自50个癌症基因的约200个扩增子,其综合癌症面板涵盖409个完整基因。Qiagen目前还提供一些癌症基因面板,计划明年与其GeneReader测序平台一起销售。

然而,LabCorp的King表示,他相信未来基于ngs的肿瘤检测将主要由集中检测实验室进行,而不是单个实验室。

“这些都是复杂而复杂的测试,”他在公司的收益电话会议上表示。“它们需要高度的专业化,所以我认为集中规模的参考实验室将是执行它们的最佳场所。”

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