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单细胞转录组谱提示转移性胃癌预后

纽约-德克萨斯大学MD安德森癌症中心领导的团队绘制出了一种转移性胃癌的单个细胞的转录组特征,这种转移性胃癌被发现于腹膜腔,称为腹膜癌病。

MD Anderson癌症中心的胃肠医学肿瘤学研究人员Jaffer Ajani在一份声明中说:“[腹膜癌]代表着一个未被满足的主要临床需求,因为我们对这些患者没有有效的治疗方案。”“基于我们的发现,我们需要对每个患者的这些细胞进行分析,以便提供更有针对性的治疗方案。”

当他们报道自然医学周一,Ajani和他的同事研究了来自15名胃腺癌患者的45,048个腹膜癌细胞的单细胞RNA序列谱,利用细胞谱系和差异表达基因分析,发现了12个基因的表达特征,这似乎与腹膜癌患者的生存结果一致。

研究人员随后验证了预后特征——它似乎将肿瘤分为“胃主导”组和“胃肠道混合”组——使用了另外1336例胃腺癌病例的数据,这些病例被癌症基因组图谱项目和其他三个大型研究队列所考虑。

MD Anderson的基因组医学和生物医学研究人员王凌华在一份声明中说:“有趣的是,通过根据谱系组成对肿瘤细胞进行分类,我们注意到两组患者。”“胃样[腹膜癌]细胞具有侵袭性表型,存活时间较短。然而,肠样(腹膜癌)细胞的侵袭性较低,患者存活时间更长。”

除了提出的预后特征,研究小组使用其单细胞RNA-seq数据和其他分子、基因型和表型线索来检查有助于腹膜癌形成和特征的细胞类型和谱系,以及转移到腹膜空间的胃腺癌肿瘤背后的肿瘤内异质性的本质。

虽然先前的研究广泛表明,高水平的瘤内异质性往往标志着胃腺癌病例的预后比通常情况下差,但研究人员注意到,单细胞转录组方法提供了对预后影响因素的更近距离观察,这可能会得到该领域进一步研究的支持。

阿贾尼在一份声明中表示:“这是更好地了解这些癌细胞的单细胞生物学的重要的第一步,但我们还有更多的工作要做。”“我们预计,了解这种异质性有一天可以用于指导对每个患者最有利的临床决策。”

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