由英国、西班牙、丹麦和美国的研究人员领导的一个国际团队已经在欧洲或亚洲血统的个体中追踪到新的生殖系对结直肠癌(CRC)发展的贡献,突出了以前未被重视的生物学途径的潜在作用。
"我们的发现为结直肠癌提供了新的见解,并极大地扩展了我们对基因变异在遗传性结直肠癌中所起作用的认识共同第一作者弗雷德·哈钦森癌症研究中心公共健康科学研究员和生物统计学家李·许在一份声明中说。
当他们报道在自然遗传学周二,Hsu和同事们收集了之前全基因组关联研究的数据,进行了GWAS荟萃分析,其中包括超过100,200例CRC病例和近150,600例未受影响的对照,这些病例都具有欧洲或亚洲血统。
"弗雷德·哈钦森癌症研究中心的公共卫生科学研究员明塔·托马斯在一份声明中说:“了解这些遗传因素以及哪些人群面临的风险最大,可以指导临床医生建议预防措施和更频繁的筛查,从而提前诊断和治疗,并为患者带来更好的生存结果。”
他们报告说,在他们的条件分析中,他们发现了155个与CRC风险相关的snp,以及30多个以前未被认识的风险位点的snp,以及13个与疾病相关的snp。
研究小组通过转录组范围的关联和转录异构体范围的关联分析,追踪了另外53种新的CRC风险变异,其中包括1100多个结直肠粘膜样本的新的和公开的表达谱;TWAS使用49种组织类型的16,800多个样本的新和现有表达数据进行;以及一项基于近500份结直肠黏膜样本定量甲基化谱的甲基化范围的关联研究。
“我们对我们的研究发现感到兴奋,包括这种严重疾病增加了100多个遗传风险变异,”共同资深和共同通讯作者乌尔里克·彼得斯(Ulrike Peters)在一份声明中说,他是弗雷德·哈钦森癌症研究中心和华盛顿大学的分子和遗传流行病学家,他在一份声明中补充说,“我们发现的每个基因和途径都是预防性治疗的潜在目标。”
研究人员报告说,新的和已知的风险变异集似乎影响了155个基因,变异和基因水平的分析指向了已知的风险途径,以及以前与疾病无关的生物过程。
“跨组织分析表明,结直肠粘膜是许多效应基因最可能的作用位点,但一些基因更可能在不同的组织类型中起作用,”作者报告说,并补充说,“几个可靠的效应基因在神经发生中起主要作用,提高了肠神经系统参与CRC风险的有趣可能性。”
例如,虽然大量CRC候选基因落在与细胞增殖、干性或分化有关的途径中,但其他基因则涉及肠道稳态、细胞粘附或迁移、表观遗传学、免疫和组织与微生物的相互作用以及其他过程。
他们的交叉特征分析指出,结直肠癌风险与已经与结直肠癌相关的几个特征或生活方式风险因素的遗传因素之间至少有十几种联系,包括体重指数、胰岛素抵抗和吸烟。
此外,该研究的作者解释说,这些发现为潜在的治疗靶点或标记提供了线索,以帮助发现可能受益于早期或预防性治疗的高危人群。
他们写道:“总的来说,我们的发现证明了多组学在为结直肠癌的生物学基础提供新见解方面的力量,包括对候选效应基因的识别和对以前未怀疑的功能机制的支持。”他们指出,“我们已经确定的几个基因和途径是结直肠癌治疗或化学预防的潜在靶点。”