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纳米线有望通过NGS读出技术推动下一波数字空间分析技术的发展

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去年12月,Nanostring与Veracyte达成了一项价值6000万美元的授权协议,将其临床诊断业务剥离,并重新专注于其作为研究平台提供商的核心业务,并预计其nCounter基因表达分析仪器的稳定销售,以及今年对其更新的空间基因组学平台的采用。

在电话里讨论公司的第四季度和全年收益本周,NanoString总裁兼首席执行官布拉德·格雷表示交出了Prosigna乳腺癌诊断此外,Veracyte还获得了其他一些未来诊断分析的商业化权利,这是该公司实现财务收支平衡的关键。

Gray表示,扩大GeoMx数字空间分析器的客户群是NanoString公司2020年的首要任务。格雷表示,该公司预计该平台的订单量将在2019年增加约50%,相当于约90个新订单。与此同时,该公司的nCounter业务可能会保持过去一年左右的稳定状态,“没有Prosigna的干扰和成本,”格雷补充道。

去年春天,NanoString推出了GeoMx, Gray表示,公司2020年的战略有两个方面,第一个方面是加强迄今为止的大量客户基础转化研究

“十年来,转化研究一直是NanoString的核心市场,这反映在我们在生物制药公司和学术医疗中心的Ncounter系统的庞大安装基础上,”Gray说,“今天销售的几乎每一个GeoMx系统都进入了转化研究。”

有了GeoMx,该公司有可能锁定想要扩展到空间分析的现有nCounter用户,以及对空间基因组学感兴趣的新客户,他们可能会被说服引入nCounter,或者更愿意在手头的测序仪上读取数字空间分析仪器。

Gray表示,人们对NanoString技术访问计划(TAP)的持续兴趣是增加公司信心的一部分,它将能够在明年继续vwin德赢ac米兰合作推动GeoMx的采用。

“我们看到整个2019年TAP项目的稳步连续增长,第四季度预订了约50个新项目。到目前为止,我们已经为超过125个客户完成了200多个TAP项目。”

他还表示,DSP研究仍有一个快速的漏斗进入科学文献该公司认为,这是产生并维持翻译研究界对该平台兴趣的关键因素。

“到目前为止,已经有13篇同行评议的出版物包含了GeoMx数据,重要的是,这些出版物在各自的领域都很受关注。”这些研究包括两篇论文同时发表于自然今年1月,描述了一种新方法的发展,以确定与患者对癌症免疫疗法的反应相关的基因表达签名。

Gray表示,为了充分利用DSP市场,NanoString在2020年的下一大步将是计划在年中推出对NGS平台的GeoMx读出的支持。他认为,这将使公司能够有效地将目标客户从转化研究转向生物和生物标志物发现市场。

Gray说:“对于这些客户来说,更多的信息通常是更好的,因此使用NGS读出基因组学来大量增加RNA含量是很有吸引力的。”他估计,通过将GeoMx系统放在目前安装的Illumina测序仪的上游,NanoString可以将其潜在市场增加大约20倍。

为此,NanoString最近推出了首个用于NGS读出的检测方法,目前只能通过TAP获得:a癌症转录组小组它整合了该公司现有的三种nCounter系统面板的内容——panccancer Pathways、panccancer Immune Profiling和io360面板,以及其他基因内容。

Gray说,该公司还在去年第四季度上线了两个外部NGS早期访问站点。

此外,在本周的年度基因组生物学和技术进展会议上,NanoString展示了10项GeoMx研究,所有这些研究都具有测序读数。vwin德赢ac米兰合作

大多数人使用的是该公司的癌症转录组图谱面板,格雷证实,该面板将在今年年中左右提供给GeoMx的内部客户。每个样品的定价为1250美元,该公司预计该检测方法将同时吸引发现和转化研究客户。

NanoString将研究人员在会议上的演讲分为几类。据该公司称,少数研究集中于发现“传统批量分析不易检测到的”新型空间生物标志物。

在这些研究中,研究人员共享了使用癌症转录组图谱的数据,以检查转移性前列腺癌样本的组织微阵列和描述免疫反应,检测与早期黑色素瘤发展相关的生物标志物的微环境特异性表达,并分析胰腺导管腺癌中的肿瘤、成纤维细胞和免疫区室。

其他报告反映了更多以发现为导向的工作,Gray说,这代表了NanoString向前发展的一个更大的未开发市场,其中一些特色实验使用了当前癌症转录组面板的后续产品——GeoMx整个转录组地图集——NanoString计划在2020年底之前为TAP用户上线,并在2021年推出更广泛的商业应用。

其中包括一项由桑格研究所的研究人员使用GeoMx分析神经干细胞、中间祖细胞和胎儿大脑皮层神经元的整个转录组谱。

布罗德研究所(Broad Institute)的研究人员利用该公司的全转录组图谱(Whole Transcriptome Atlas)研究结直肠癌中肿瘤和微环境相互作用在空间上的变化。

在本周的收益电话会议上,NanoString回答了以下问题:由于知道完整的转录组内容要到明年才能获得,潜在的GeoMx发现研究客户是否会推迟购买系统。

但是Gray说,他对整个转录组能力的提高充满信心,而不是降低客户对DSP平台的兴趣。

“很难预测我们所产生的所有兴趣……何时会变成订单的确切时间。我预计,我们将在下半年开始看到这一点,随着时间的推移,我们将对转化和发现市场之间的仪器订单组合发表更多评论,”他说。

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