纽约(GenomeWeb) -两项新的研究使用单细胞RNA测序来分析小鼠或人类的气管或支气管组织,为气道和肺部细胞之间的关系提供了更清晰的理解,同时确定了一种似乎与囊性纤维化生物学相关的新细胞类型。
布罗德研究所Klarman细胞天文台主任、人类细胞图谱联盟联合主席Aviv Regev在一份声明中说:“我们创建的图谱已经开始极大地重塑我们对气道和肺部生物学的理解。”
为其中一项新研究,今天在网上出现自然Regev、共同资深作者Jayaraj Rajagopal和来自马萨诸塞州总医院、布罗德研究所和其他地方的同事对近7500个小鼠气管上皮细胞的RNA进行了测序,并进行了实验在活的有机体内细胞谱系追踪实验,脉冲序列分析,和谱系层次分析。
有了这些信息,研究小组探索了小鼠气道中细胞类型的起源、发育轨迹和相互作用,同时确定和描述了以前不被重视的肺细胞类型和亚型。
隶属于MGH、哈佛干细胞研究所和Broad研究所的再生医学研究员Rajagopal在一份声明中说:“我们已经发现了整个细胞类型的分布,它们似乎在功能上是相关的。”
他补充说:“与复杂肺部疾病相关的G细胞现在可以与我们所描述的特定细胞联系起来。”他指出,“数据开始改变我们对囊性纤维化和哮喘等肺部疾病的看法。”
特别是,该团队描述了一种罕见的新细胞类型,称为Foxi1+肺离子细胞,这是因为细胞的基因表达与鱼类和青蛙中专门的离子转运调节离子细胞有关。这些细胞以囊性纤维化基因CFTR的增强表达为标志,该基因在缺少Foxi1转录因子编码基因的小鼠离子细胞中下降。
对于相关的研究今日在网上公布自然由诺华生物医学研究所(Novartis Institutes for BioMedical research)领导的团队根据自己对7600多个小鼠气管上皮细胞和2970个原代人支气管上皮细胞的单细胞RNA-seq数据的分析,提供了关于肺离子细胞类型的更多细节。
通过结合电生理学、成像和其他数据,研究人员不仅检测了肺离子细胞中Foxi1、CFTR和空泡型H+- atp酶亚基的表达,而且还确定了Notch信号在细胞类型中的关键作用。
更广泛地说,在小鼠和人类细胞组中收集的数据“揭示了代表已知和新细胞群的细胞状态,描绘了它们的异质性,并确定了稳态和组织修复过程中不同的分化轨迹,”诺华生物医学研究所呼吸疾病研究员阿隆·贾菲(Aron Jaffe)和哈佛医学院系统生物学研究员阿隆·克莱恩(Allon Klein)及其合作者写道。