纽约——来自加利福尼亚的一项回顾性研究的结果表明，新生儿血液斑点样本的外显子组测序具有发现遗传先天代谢错误(IEM)的潜力，以一种补充传统的以质谱为基础的新生儿筛查测试。
作为NBSeq项目的一部分，加州大学伯克利分校(University of California at Berkeley)、加州大学旧金山分校(University of California at San Francisco)和其他地方的研究人员利用了加州公共卫生部生物库中的干血点样本，代表了2005年至2013年期间接受IEM检测的数百万婴儿。
在研究的发现和验证阶段，研究人员从1200个被识别的新生儿中选择了一个干血点子集，用于外显子组测序。他们解释说，这一组包括800多名已知IEM的新生儿，以及385名通过串联质谱筛查的IEM假阳性结果的婴儿。
加州大学伯克利分校和加州大学旧金山分校的Steven Brenner和加州大学旧金山分校的Jennifer Puck及其同事在一份报告中写道:“这项研究代表了迄今为止对整个iem感染病例人群进行测序的最大努力，允许对(全外显子组测序)目前作为人群筛查工具的能力进行无偏见的评估。纸发表在自然医学周一。
基于对78个基因的分析，这些基因先前涉及到目前加利福尼亚州新生儿筛查项目中包含的40多种IEM形式，研究团队发现，基于外显子组测序的策略可以以88%的灵敏度检测出真正的IEM，而基于串联质谱的检测的灵敏度为99%。本研究的外显子组测序筛选部门发现IEMs的特异性超过98%，而建立的串联质谱筛选方法检测IEMs的特异性为99.8%。
基于NBSeq分析的这些和其他结果，作者认为“[全外显子组测序]单独作为大多数[新生儿筛查IEMs]的主要筛查不够敏感或特异性。”然而，作为MS/MS筛查异常婴儿的辅助检测，[全外显子组测序]可以减少假阳性结果，促进及时解决病例，在某些情况下，甚至建议比最初获得的更适当或更具体的诊断。”
NBSeq项目开始为期五年试点研究该研究集中在外显子组测序的潜在应用和意义上，以发现和更好地理解代谢2013年，国家人类基因组研究所和国家儿童健康与人类发展研究所为这项初步研究提供了450万美元的资金。
加州大学旧金山分校的冰球提供了一个更新去年春天，在美国国立卫生研究院的“基因组医学和公共卫生中的新生儿测序”(NSIGHT)公开会议上。她特别指出，虽然外显子组测序的敏感性低于传统的基于质谱的IEMs筛查，但测序方法确实发现了过去没有报道的变异，提供了对可能导致这种情况的基因改变的更清晰的观察。
在这篇新论文中，她和她的合著者指出，NBSeq的结果“阐明了加利福尼亚州IEMs的遗传景观”，同时强调了新生儿测序的人群筛查潜力和相关考虑。
他们写道:“[新生儿测序]IEMs为评估测序在人群筛查中的作用提供了一个理想的模型，因为大多数是孟德尔疾病，影响众所周知的生化途径，其中许多已经被广泛研究。”他们指出，“基于序列的IEMs检测的敏感性和特异性可以直接与目前的MS/MS筛查进行比较。”