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在零星病例中发现als相关基因的新变异

纽约(基因组网)-研究人员已经发现了部分散发的肌萎缩性侧索硬化症病例背后的遗传原因。

渐冻症是一种最终会致命的渐进性神经系统疾病,可能是家族性的,也可能是散发性的。家族性ALS约占ALS病例的10%,是一种典型的常染色体显性疾病。而散发性肌萎缩性侧索硬化症是在没有已知的家族病史的情况下被诊断出来的。

为了发现散发性渐冻症的遗传原因,犹他大学医学院的研究人员分析了87名散发性渐冻症患者的外显子和某些基因重复区。正如他们在神经学昨天,研究人员在17%的患者中发现了可能有害的罕见基因突变。

“我们的研究结果强调,遗传因素在这种疾病中发挥着重要作用,这在一个以基因为中心的治疗时代是重要的,”第一作者、犹他大学的神经学家Summer Gibson在一份声明中说。“更大比例的散发性肌萎缩性侧索硬化症病例可能有遗传成分。”

她和她的同事招募了96名2011年至2013年间诊断为散发性肌萎缩性侧索硬化症的患者参与研究。经过质量控制,来自欧洲血统患者的样本保留了87份。

研究人员使用Illumina HiSeq平台对这些散发的ALS患者进行了41 - 224X的全外显子组测序。同时,他们用荧光PCR扩增方法测定ATXN2 CAG重复序列的大小,用重复引物PCR方法测定C9orf72 GGGGCC重复序列的扩增,这两种重复序列都与ALS相关。

研究人员报告说,研究中有两名患者的ATXN2重复扩增,而有五名患者的C9orf72重复扩增。

通过外显子组数据,研究人员检查了他们的队列中是否存在31个als相关基因的变异。这些基因包括ERBB4、SOD1和SQSTM1等。

在他们的队列中,两名散发的ALS患者是已知ALS风险变异SOD1: p.p asp91ala的杂合子。

但是,研究人员还在他们的队列中发现了18个罕见的编码变异,这些基因之前没有与ALS相关。这些罕见的编码变体中有10个不在dbSNP中,6个似乎完全是全新的,因为它们不在ExAC、1000基因组计划或国家心肺和血液研究所外显子组测序计划的数据集中。

总的来说,Gibson和她的同事在25名患者中发现了31种als相关基因的28种罕见变异或重复扩增。三名患者在als相关基因中有两种罕见的变异。

基于此,他们计算出28.7%的散发性肌萎缩侧索硬化症患者至少有一个罕见的基因变异或重复扩增。

研究人员还考虑了这些变异是否被预测为有害的因素。在这种情况下,17.2%的散发性肌萎缩性侧索硬化症患者至少有一种可能有害的罕见变异或重复扩张。在Simons Simplex收集的对照组中,只有4%的人具有这种罕见的、可能有害的ALS基因变异。

尽管研究人员提醒说,他们的研究规模很小,但他们表示,研究表明,ALS患者感染这些罕见且可能有害的变异的可能性是其他人的四倍。

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