纽约-纽约市卫生和精神卫生局(dohhh)和美国国会分别启动了促进新一代基于测序的SARS-CoV-2病毒监测的努力。
周三,纽约市卫生部门发布了一项紧急采购请求,要求承包商对检测结果为SARS-CoV-2阳性的样本进行全基因组测序。
根据请求该合同将优先考虑“在接到合同通知后,每周至少执行96个COVID-19阳性检测序列,在四周后能够增加到每周至少大约150到350个序列”,并能在7天内生成和分析数据的承包商。
在周二的新闻发布会上,纽约市卫生部门专员戴夫·乔克什表示,自2021年1月1日以来,大约1500个来自纽约居民的样本已经在该市的公共卫生实验室、州公共卫生实验室和学术实验室之间进行了测序。他补充说,他预计测序能力将在下周显著提高。
周四,参议员塔米·鲍德温(威斯康辛州民主党人)和众议员艾米·贝拉(加州民主党人)和斯科特·彼得斯(加州民主党人)提议为一个由疾病控制和预防中心管理的全国冠状病毒监测项目提供超过20亿美元的资金。
鲍德温计划引进《追踪新冠病毒变异法案》在参议院,紧随其后的是众议院的配套法案。除了为识别和跟踪新出现的SARS-CoV-2变种的下一代测序提供资金外,该法案还为一个示范项目提供1000万美元,以促进公共卫生研究。
该法案还呼吁美国疾病控制与预防中心提供全国性指导,“包括与共享从患者身上获得的标本、安全共享有效应对COVID-19所必需的此类标本的信息,以及适当使用从此类标本中获得的病毒序列数据相关的指导。”它特别提到了对该机构高级分子探测计划的支持。
鲍德温在一份声明中说:“变异病毒对我们国家的健康和安全构成越来越大的威胁,目前美国在追踪这种致命病毒的新变种和正在出现的变种方面落后于其他国家。”“美国应该是这方面的世界领导者,这意味着我们必须投入更多的资金和资源,让CDC加强国家序列监测,支持我们的公共卫生基础设施,这样我们就可以更好地识别、调查和理解这些变体,更好地保护所有美国人免受这场公共卫生危机的影响。”
《追踪COVID-19变异法案》指出,美国只有0.3%的COVID-19病例进行了测序,“远远落后于其他国家”。相比之下,英国已经测序了约6.8%的冠状病毒病例最近的报告从英国COVID-19基因组学协会.
美国微生物学会首席执行官Stefano Bertuzzi在一份声明中说:“增加测序能力不仅将在识别、跟踪和减轻新基因菌株的影响方面发挥关键作用,而且还将在疫苗开发、分发、测试和使我们的经济回到正轨方面发挥关键作用。”
彼得斯代表加州52个选区nd该地区包括测序巨头Illumina公司的总部所在地圣地亚哥北部。