研究人员美国东北大学和太平洋生物科学公司计划使用国家人类基因组研究所82.5万美元的三年拨款，以减少PacBio测序技术的DNA输入要求和成本。vwin德赢ac米兰合作
该团队由太平洋生物科学公司的Jonas Korlach和东北大学的物理学家和化学生物学教授Meni Wanunu领导，他们将使用在Wanunu实验室开发的方法，通过操纵分子进入每个零模波导的速率和排他性，来提高PacBio单分子实时测序的效率和降低成本。
PacBio/Northeastern小组是上周在NHGRI的先进DNA测序技术计划下获得总计1900万美元拨款的六个项目之一。vwin德赢ac米兰合作
太平洋生物科学公司创始人兼首席技术官史蒂夫·特纳告诉记者vwin德赢ac米兰合作按顺序该公司不确定该项目能在多大程度上降低测序成本，但团队预计通过一个方面的努力，效率至少能提高三倍。
他说:“这些赠款资助活动的部分功能是使像我们这样的商业组织能够追逐收益更大、也更有风险的东西，所以很难预测收益会有多大，但可能会非常大。”
特纳说，该项目将基于瓦努努开发的利用电场控制DNA分子的方法。主要目标将是使用瓦努努的方法——他在自然纳米技术vwin德赢ac米兰合作在2010年——控制分子在PacBIo波导中的分布，这样一来，在一个分子“进入竞技场”后，特纳说，“它的存在将关闭其他任何进入的大门。”
“今天，我们必须使用统计分布，并依赖于绑定的随机性，以确保有时我们(在每个波导中)只能看到一个聚合酶测序。其余的时间我们要么一个都没有，要么一个以上，这是没有效率的，”特纳说。“所以，你可以有一个可以关上它背后的门的分子，这意味着我们基本上可以让所有的功能测序单元提供数据。”
Wanunu告诉按顺序他的方法是在一个分子进入波导后关闭众所周知的门，这需要在波导孔的底部放置一个纳米孔。
Wanunu说:“如果你把波导想象成一个井，我们将在每个井中放置一个聚合酶的结合位点，我们要做的是在那里设置一个孔隙(小50倍)。”“这将使功能从37%提高到理论上的100%。”
Turner同意，基于该公司目前所达到的最佳性能情况，这种纳米孔关门可以提高吞吐量，因此可以将测序成本提高三倍。
但确保每个波导只包含一个分子只是该小组希望利用瓦努努的电操纵方法来提高效率和降低成本的方法之一。
特纳说，静电控制方法还可以降低输入DNA的浓度。他说:“当你用电场移动一个分子时，会发生的一件事是，你可以从很远的地方引导它，(也就是说)在更低的浓度下。”“在那里，我们不仅仅是在谈论(减少投入)三倍;可能是几百或1000倍。”
瓦努努说:“你可以把波导想象成租赁的东西。”“每条链都有一定的寿命，在这段时间内，我们希望尽可能多地测序。如果你的DNA没有进入井中，你只能做到这一步，所以这就是我们降低成本的方法。”
根据特纳的说法，这些“定量”的进步可能会让PacBio的一些应用程序处于可行的边缘，并“把它们推到边缘”。
例如，他说:“这将使癌症活检测序实验中没有足够的DNA，然后使其有足够的DNA……或者以一个经济上没有足够覆盖的系统为例…通过将成本削减到三分之一，这将使它在经济上可行。”
他补充说，法医和考古学应用也可以通过较低的DNA输入要求更好地实现，以及对DNA高重复性区域的测序，研究人员可能需要比PCR扩增更长的读取长度。
特纳说，该公司认为，在Wanunu的静电聚焦方法中，控制单个分子的位置可能有更多的可能性。“能够从一组分子中指定一个特定的分子到某个地方进行测序……这与我们所习惯的完全不同。”
“现在，我们把所有东西都当作割草机袋子里的东西。总有一天我们会更像一个园丁。”