由多伦多儿童生病医院(Sick Kids)的研究人员领导的一个国际团队记录了一种名为儿童低级别胶质瘤(pLGG)的脑瘤亚型的基因改变,这种改变与患者预后的好坏相关。
通过综合1000多名患有pLGG儿童的影像学、组织学、靶向DNA测序、RNA测序、临床和其他数据,研究人员将范围缩小到两大类肿瘤,这些肿瘤要么以复发性重排为标志,要么以单核苷酸变异为标志。他们指出,一般来说,重排丰富的肿瘤往往出现在相对低风险的pLGG病例中,而某些单核苷酸变化与中等或高风险的pLGG病例相一致。
“[pLGG的形态学、成像、临床和分子分析]使我们能够全面研究分子基础,并为一些最罕见的pLGG分子亚型提供全面的临床见解,”共同资深和通信作者辛西娅·霍金斯(Cynthia Hawkins)和她的合作作者在一份报告中写道纸发表在癌症细胞周一。
“这些数据可以指导诊断方案和治疗方法,”他们补充说,“同时帮助加快在不久的将来针对这些儿童的新的、更有针对性的疗法的临床试验,”他们写道。
Hawkins和她的同事从20世纪80年代中期到2017年期间在Sick Kids医院治疗的976例pLGG患者的数据开始,重点关注了477例可以通过RNA-seq、NanoString nCounter分析、基于阵列的SNP分析、靶向DNA测序、液滴数字PCR和免疫组化等方法成功分析的病例。
研究人员报告说,大约三分之二的病例包含BRAF或NF1突变,或KIAA1549-BRAF融合,约84%的pLGG肿瘤包含已知驱动基因突变。此外,在许多没有明确驱动突变的肿瘤中,RAS/MAPK活性增强。
研究小组还从pLGGs中经常发生的突变类型中得出了预测结果。例如,265个肿瘤簇似乎具有重排相关的驱动因素。研究人员指出,这些肿瘤在10岁前确诊为pLGG的儿童中比例过高,约88%的儿童组织学分级为I级。在那些与重新安置有关的病例中,10年的总生存率接近98%。
另一方面,182个以单核苷酸变异为特征的肿瘤中,超过一半发生在10岁以后诊断的儿童身上th生日,研究人员报告。他们发现,大约三分之一的肿瘤组织学为II级,这组pLGG患者的10年总生存率下降到88%。
当研究小组将其分析扩展到61名患有罕见肿瘤改变的pLGG患者时,发现了类似的模式,这些患者曾在美国的一些中心进行过分析,包括圣裘德儿童研究医院、费城儿童医院和纪念斯隆-凯特琳癌症中心。
总之,作者指出,“这种pLGG临床和分子特征的综合分子景观为临床医生提供了宝贵的资源,以管理常见和罕见的分子pLGG亚型。”