纽约(基因组网)-一项回顾性分析发现，人乳头状瘤病毒(HPV)阳性口咽鳞状细胞癌(OPSCC)患者的肿瘤基因表达特征与患者预后明显相关。
利用癌症基因组图谱项目中80个OPSCC肿瘤的RNA序列数据，来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心和其他地方的研究人员探索了HPV转录变异和肿瘤表达谱之间的关系。
“由于HPV阳性驱动放疗敏感性，我们假设HPV生物学变异可能导致治疗反应和结果的差异，”MD安德森癌症中心头颈外科研究员、高级作者Curtis Pickering和他的同事写道，并补充说，“我们的目标是探索HPV功能与分子和临床表型之间的联系。”
他们的结果，今天在网上报道江森自控的洞察力发现了与HPV相关的致癌的新线索，并揭示了582个与HPV状态相关的人类基因，这些基因的表达谱将肿瘤聚为三组:一组包含HPV阴性肿瘤，两组包含HPV阳性肿瘤。
尽管28个hpv阴性肿瘤集群的5年总生存率最低，与之前的报告一致，该团队注意到，5年总生存率也在hpv阳性OPSCC组与下一个组之间存在差异。其中19名患者的肿瘤高风险组的生存状况略好于hpv阴性组，但远比第二组33名hpv阳性患者的生存状况差。
皮克林在一份声明中说:“hpv阴性的肿瘤明显不同，但在hpv阳性的肿瘤中有两个不同的组。”他指出，“一个hpv阳性亚组的生存率与hpv阴性患者相似。”
当他和他的团队进一步挖掘数据时，他们缩小了在两个hpv阳性肿瘤集群中差异表达的38个hpv相关基因。同时，与hpv阴性的OPSCC肿瘤相比，预后更好的hpv阳性肿瘤在166个基因上有差异表达，而在hpv阴性和高风险的hpv阳性肿瘤之间只有94个差异表达基因。
“高危组在HPV-和HPV+ OPSCC肿瘤之间表现出改变或中间基因表达谱，”作者写道。
在他们随后的分析中——包括在独立的hpv阳性OPSCCs和其他鳞状细胞癌(如宫颈鳞状细胞癌)中验证提出的38个基因预后生物标志物——研究人员再次看到了5年的生存差异。减少可能的预后标记集的努力表明，hpv阳性的OPSCC生存线索可能来自三个基因的表达:IKZF3, ARHGAP26和CACNA1D。
皮克林说:“我们已经发现了一些与致癌过程、肿瘤进展和治疗反应有关的HPV生物学的新基本方面。”“如果我们能够在未来的研究中验证这一点，它将在多种hpv相关的肿瘤类型中具有不可思议的临床价值。”
研究小组解释说，随着hpv阳性OPSCC病例的增加，人们有兴趣发现预后生物标志物，以区分低风险患者(可以避免积极的放疗)和高风险患者(更容易需要显著的临床干预)。
皮克林说:“hpv阳性口咽肿瘤患者在放疗后存活很长时间，但通常会留下严重的长期发病率，包括说话或吞咽问题。”他解释说，“临床医生希望减少或降级治疗，以减少严重的副作用。”