来自中国和美国的一个研究小组分享了对中国数百例前列腺癌病例的基因组、转录组和表观基因组分析的结果，发现这些患者存在与西方国家患者不同的复发性突变。
研究人员报告说:“基因组和表观基因组的改变是相关的，可以预测疾病的表型和进展。”研究人员指出，在这些病例中发现的更广泛的突变和表观遗传变化“集中在对前列腺癌很重要的途径上，为这种毁灭性疾病提供了见解。”这项工作由上海第二医科大学泌尿学研究人员孙英浩和高旭以及华盛顿大学的共同高级作者王婷领导。
当他们报道在自然周三，研究人员使用全基因组测序、RNA测序、microRNA测序和全基因组亚硫酸氢盐测序，从200多名中国男性局限性前列腺癌患者的肿瘤样本中寻找体细胞突变、表达转移和甲基化变化。
最终得到的数据集——该团队称之为“中国前列腺癌基因组和表观基因组图谱”(CPGEA)——指出FOXA1突变和其他改变似乎在前列腺癌病例中被过度代表。这些体细胞改变在西方国家前列腺癌患者的数千个肿瘤样本中出现的频率要低得多，这些肿瘤之前已经发现TMPRSS2和ETS转录因子基因之间存在频繁的ETS融合。
作者报告说:“对来自CPGEA和西方队列的样本进行比较分析，发现同一疾病的突变格局存在显著差异。”“尽管ETS融合一直被认为是前列腺癌的旗舰突变，但我们的研究无可争议地将FOXA1突变定位为中国人群中最突出的特征。”
在他们的研究中，研究人员专注于肿瘤，并匹配了来自中国的208名接受根治性前列腺癌手术治疗的男性的正常组织。他们指出，他们的比较基因组、转录组和表观基因组分析集中在这些肿瘤中的177个，这些肿瘤之前没有接受过治疗。
在肿瘤的其他改变中，包括与特定前列腺癌特征或进展相吻合的基因组和表观基因组特征，研究小组在41%的肿瘤中发现FOXA1基因突变，以及约18%的肿瘤中复发的ZNF292和CHD1基因缺失。
新测序的前列腺肿瘤中的这些基因变化和其他“组学特征”与来自世界其他地区的2,554名前列腺癌患者的现有数据不同，其中包括十多个西方队列。他们指出，先前的研究表明，在西方，超过一半的前列腺癌以ETS融合为特征。
作者写道:“FOXA1突变在中国前列腺癌中的频率和独特模式强调了研究个体突变的致癌机制的必要性，以及使中国个体易患这些突变的因素。”