纽约(基因组网)-根据威康信托桑格研究所的研究人员领导的一项研究，与红头发相关的基因也与黑色素瘤中体细胞突变负荷的增加有关。
桑格研究所的大卫·亚当斯(David Adams)和他的同事从癌症基因组图谱和耶鲁黑色素瘤基因组计划中研究了约400名黑色素瘤患者的体细胞突变景观，并将其与患者所携带的黑色素皮质素1受体(MC1R)等位基因相关联。MC1R编码一种在黑素细胞表面发现的g蛋白偶联受体，与黑素瘤风险有关。
正如研究人员报告在今天自然通讯在美国，有一个或两个R等位基因的黑色素瘤患者比没有R等位基因的人有更高的突变负荷。R等位基因是一种等位基因，当它以两个副本的形式出现时，与红头发、雀斑和晒伤倾向有关。这些患者的突变特征表明，这些突变是在阳光照射后产生的。
亚当斯在一份声明中说:“众所周知，红头发的人患皮肤癌的可能性更高，但这是第一次证明该基因与更多突变的皮肤癌有关。”
他和他的同事检查了TCGA和耶鲁黑色素瘤患者队列中存在的snv，并将每个患者的所有非同义和无意义的MC1R变体分为R、R或野生型。大约8%的TCGA队列有两个R等位基因，41%的队列有一个，51%的队列没有。同样，耶鲁队列中4%的患者有两个R等位基因，41%有一个，55%没有。
研究人员还根据核苷酸变化的类型对他们发现的snv进行了分类，比如它是胞嘧啶到胸腺嘧啶的转变还是胸腺嘧啶到腺嘌呤的转位。然后，使用负二项回归，他们建立了预期的SNV负担和MC1R等位基因存在之间的关系模型。
对于所有六种突变类型，研究人员注意到，在拥有一或两个R等位基因的患者中，snv的负担会增加。在对测试6种突变类型进行校正后，他们报告了合并数据集中所有6种突变类型的预期SNV计数和观察到的SNV计数在统计上有显著差异。Adams和他的同事进一步计算出，携带一个或多个R等位基因与预期体细胞SNV计数增加42%有关。
亚当斯补充说:“出乎意料的是，只有一个基因变体副本的人，其肿瘤突变数量仍然比其他人群高得多。”“这是第一个共同基因图谱对癌症基因组有很大影响的例子，可以帮助更好地识别出患皮肤癌风险较高的人。”
他和他的同事还报告说，8个突变特征占了合并数据集中出现的突变的近98%，而与阳光暴晒相关的胞嘧啶到胸腺嘧啶的替换是所有基因型中最常见的突变。
通过抑制人类初级黑色素细胞细胞系中的MC1R——减少但没有消除MC1R的表达——并将这些细胞暴露在越来越多的紫外线下，研究人员发现，MC1R表达减少会影响生存和DNA修复，并导致环丁烷嘧啶二聚体增加，这是对阳光照射的反应，导致胞嘧啶到胸腺嘧啶的取代
英国癌症研究中心健康和患者信息负责人朱莉·夏普在一份声明中说，研究结果还强调了人们保护自己免受日晒的必要性。她补充说:“不仅仅是红头发的人需要保护自己免受过多阳光的伤害。”那些容易被晒伤而不是晒黑的人，皮肤、头发或眼睛白皙的人，或者有雀斑或痣的人，也有更高的风险。”