纽约——新的研究表明,不同祖先背景的个体,其肾细胞癌(RCC)的遗传倾向似乎有所不同。
研究人员利用1800多名患有一种或多种RCC肿瘤的个体的靶向种系序列数据,寻找与RCC相关的致病或可能致病的风险变异,在约17%的被测者中鉴定出RCC相关基因的此类变异。他们指出,虽然超过10%的参与者携带临床可操作的变异,但这些变异在FH和CHEK2基因中的分布似乎因个人的祖先而有所不同。
研究小组指出,尽管过去许多研究RCC遗传风险的研究都是在欧洲血统的个体中进行的,但目前的研究结果表明,FH基因中致病或可能致病的变异倾向于与非洲血统一起增加。相比之下,危险的CHEK2种系变异更多地出现在非芬兰欧洲血统的个体中。
“这项工作有助于了解非洲人和非非洲人之间RCC的潜在生物学差异,并为代表性不足人群的更全面的基因组表征铺平了道路,”丹娜-法伯癌症研究所的生殖泌尿肿瘤学研究员、高级通讯作者Toni Choueiri和他的同事在论文中写道细胞的报道周二。
为了进行分析,研究人员利用了1829名RCC患者的临床生殖细胞序列数据,这些患者从2017年初到2019年秋季在Invitae接受了1到100多个基因的小组测试。
根据自我报告的祖先,该队列包括近1300名白种人,94名德系犹太人血统,55名亚洲或太平洋岛民,99名非洲裔美国人,以及100多名西班牙裔人,尽管该团队还利用参与者的常见SNP谱和可用的计算工具来估计祖先谱系。
从种系序列数据中,研究人员在17%的基因中发现了致病或可能致病的变异,尤其是CHEK2、MUTYH、FH、BRCA2和ATM基因。他们指出,在过去与RCC风险有关的12个基因中,有超过5%的参与者携带有风险的变异,其中包括6个有足够数据来搜索祖先相关性的基因。
后者的分析强调了具有更多非洲血统的个体CHEK2基因中功能丧失的种系突变水平低于正常水平,这似乎与祖先特异性FH基因变异的上升相一致。尽管gnomAD数据库中保存的人口数据中CHEK2和FH基因的总体变化率相似,但欧洲血统显示出相反的模式。
作者警告说,“当在欧洲人群中确定的变异被评估时,这可能会错误地得出结论,即这些人群比非洲裔患者拥有更多的变异,因此应该更谨慎地解释。”
他们写道:“在不同的祖先中发现了几个潜在的(致病的或可能致病的)变异富集的基因,未来还需要更多非白人代表的大规模研究来证实这些发现。”