纽约(基因组网)-研究人员已经开始梳理eb病毒(EBV)的特定基因变异,这些变异对来自中国南方的个体构成了最大的鼻咽癌风险,在那里,EBV相关的鼻癌形式特别常见。
“这些高风险的EBV变异的发现……对减少NPC负担的公共卫生努力具有重要意义,特别是在中国南方的流行地区,”共同资深作者刘建军、曾益新和翟伟伟及其共同作者在一份报告中写道研究已于今日于自然遗传学.
作者写道:“对这些高危EBV变异的检测能够识别出高危人群,从而有针对性地实施常规临床监测,及早发现鼻咽癌。”“通过开发针对非传染性肺炎高危EBV株的疫苗进行一级预防,预计将大大减少中国的广东癌。”
该研究的带头人来自新加坡基因组研究所、新加坡国立大学、中国科学院和中山大学癌症中心。他们领导了一个来自新加坡、中国、美国和瑞典的团队,使用靶向捕获测序技术从患有或不患有鼻咽癌的中国人的肿瘤、唾液或血浆样本中发现了270株EBV菌株,并对其进行了特征描述。
在对来自近1300例病例或对照的EBV基因组进行两阶段关联研究的帮助下,该团队深入研究了中国南方的ncpc易感人群中与鼻癌相关的两个与EBV基因BALF2相关的非同义变体。
研究小组解释说:“鼻咽癌在世界上大多数地区都很罕见,但在中国南方是一种非常常见的癌症,每年每10万人中发病率可达20至40例。”该地区的鼻咽癌病例通常涉及EBV感染。
这种病毒与其他癌症类型有关。但它也经常出现在没有癌症的人身上,它与NPC的联系主要集中在中国南方的广东人身上。
为了补充过去的研究,研究人员对可能使该地区的个体易患EBV相关鼻咽癌的宿主变异和基因座进行了研究,对鼻咽癌患者血液、唾液或肿瘤样本中的215个EBV分离株和从健康对照个体唾液样本中收集的54个EBV分离株进行了全基因组测序。他们还对来自25名鼻咽癌患者的配对肿瘤和唾液样本中的EBV进行了测序,以观察个体内的病毒变异。
在最初的一组EBV基因组中,该团队追踪到近8500个EBV变体,包括8015个snp和454个小插入和删除。根据这些变异,他们进行了第一阶段的关联研究,中心是来自全国人大流行的广东和广西的156个病例和47个对照。
该研究强调了在发现队列中与鼻鼻癌具有全基因组显著联系的BALF2变体,研究人员通过对来自483例病例和605例对照的EBV分离株的验证测试验证了这一点。他们解释说,该基因编码一种单链DNA结合蛋白,参与了EBV感染的早期裂解阶段和DNA复制,支持了“EBV裂解周期在鼻咽癌的发展中具有重要作用”的观点。
随着对npc相关BALF2位点的精细定位分析,该团队探索了危险EBV亚型的系统发育根源,这指出了EBV中npc相关变异的亚洲起源和扩展。