根据一项新的研究，基于测序的方法可能不会取代基于生化或表型的新生儿筛查，但可以补充这些方法。
新生儿筛查始于20世纪60年代，用于检测苯丙酮尿症等疾病，后来扩大到指南建议纳入新生儿筛查计划的约35种核心疾病和26种次要疾病。
作为北卡罗来纳州新生儿外显子组测序通用筛查(NC NEXUS)项目的一部分，研究人员在筛查和诊断场景中对100多名新生儿进行了测序，其中一些已知患有代谢障碍或听力损失，一些健康。
北卡罗来纳大学教堂山分校的乔纳森·伯格和他的同事领导的团队报道于美国人类遗传学杂志周三他们发现，测序可以识别出大多数患有代谢紊乱的儿童，但只能识别出一小部分患有听力损失的儿童。然而，测序可以揭示一系列与其他儿童或成人发病疾病相关的变异，包括临床可操作的发现。
Berg和他的同事在他们的论文中写道:“在NBS的背景下，基于测序的方法不能完全取代生化或表型筛选，因为病原学异质性和变异解释的挑战。”“然而，测序方法的优势在于能够识别几乎任何已知遗传原因的疾病。因此，用某种形式的基因组测序来加强新生儿筛查似乎是不可避免的。”
研究人员招募了17名先天性代谢障碍儿童、28名听力损失儿童和61名健康婴儿参与研究。每个孩子都使用466个基因进行了基于下一代测序的新生儿筛查。通过外显子组测序在该队列中检测到的46个变异中，有43个是在clia认证的实验室中正交确认的。
在代谢队列中，基于测序的筛查在17名参与者中发现了15名异常结果。例如，先前发现的7名苯丙酮尿症儿童有PAH的病理变异，7名中链酰基辅酶a脱氢酶缺乏症儿童有ACADM的致病变异，1名原发性肉碱缺乏症儿童有致病性SLC22A5错义变异的纯合子。
然而，筛查并没有发现两个代谢队列成员的致病变异。但当研究人员揭开他们的队列时，他们注意到这两名患者具有与他们的病情相关的暗示性变异，尽管不是结论性的。
然而，在听力损失队列中，基于下一代测序的新生儿筛查在28名参与者中只有5人返回阳性结果。其中两名儿童是Usher综合征基因变异的复合杂合子，一名儿童在GJB2基因中有一个碱基对移码缺失，这与DFNB1非综合征性耳聋有关。
但基于测序的筛查无法发现大多数听力损失病例。研究人员指出，这可能是由于环境因素、感染和早产等非遗传因素造成的听力损失。
研究人员指出，这种低数量的阳性结果是意料之中的，因为他们为确定异常结果设置了很高的阈值，因为他们的队列处于单基因疾病的人群水平风险。
由于基于测序的筛查遗漏了一些代谢和听力损失的结果，研究人员指出，它可能不会取代目前的筛查方法，但可以作为它们的补充。研究人员在论文中写道:“这些发现表明，测序可能是传统NBS方法的一种辅助手段，随着对变异检测的改进……以及更广泛的解释数据库，基因组筛查的积极预测价值可能会提高。”