纽约(基因组网)——ReadCoor，哈佛大学Wyss生物工程研究所的一个分支，本周说它计划推出一种原位该平台将基于哈佛大学乔治·丘奇实验室最初开发的技术。vwin德赢ac米兰合作
为了支持这些努力，公司最近筹集了2300万美元在德成资本领投的a轮融资中。
ReadCoor首席执行官Shawn Marcell告诉GenomeWeb，该公司计划提供这种荧光剂原位测序(FISSEQ)技术即服务将于下个月vwin德赢ac米兰合作推出。它还开发了一个平台原位他说，该公司将在明年有限的基础上推出测序。
该公司总部位于马萨诸塞州的剑桥市，马塞尔表示，下一步是建立实验室空间和流程，并完成第一轮招聘。到今年年底，他预计ReadCoor将拥有大约15名员工。最近的融资应该能让它撑过一两年。
哈佛大学的研究人员发表了一篇论文FISSEQ原理的证明在科学两年前。该方法类似于Complete Genomics公司使用的DNA纳米球和结扎测序方法，只不过输入的样本是组织，而不是DNA或RNA。
ReadCoor的联合创始人、公司总裁兼首席技术官理查德·特里(Richard Terry)告诉基因组网(GenomeWeb)，其原理基本上与《华尔街日vwin德赢ac米兰合作报》中描述的相同科学纸张与主要的不同是，团队现在已经建立了一个完全自动化的平台。
为了进行3D测序，细胞内的RNA分子首先被固定，并启动进行逆转录以生成cDNA。作为反转录步骤的一部分，研究人员结合交联基团来“锁定那些cDNA分子”，Terry说。然后，他们进行滚圈放大，以产生滚圈菌落，或“rolonies..”
“我们现在有原位一个RNA分子文库，这些分子已经转化为cDNA，并使用滚圈扩增技术进行扩增，”他说。Terry说:“我们不需要将这些克隆体放在基质上，然后在细胞和组织外对它们进行测序，而是能够在组织样本内生成库”，然后可以使用基于光学的NGS化学方法对其进行测序。
Marcell说，最初的平台使用传统的结扎测序化学方法，但该团队后来开发了一个改进版本，称为结构化结扎测序。马塞尔说，这种方法比标准的结扎测序快大约5倍。他说，最初的商业平台可能会使用标准的结扎测序方法，但随后的升级将包括ReadCoor的方法。
Terry说，该平台本身的大小与Illumina HiSeq系统相当，包括显微镜风格的自动光学系统，类似于其他NGS仪器。它与新鲜冷冻或福尔马林固定的石蜡包埋组织兼容，其通量取决于许多不同的指标，包括组织类型和具体的科学问题。此前，研究人员报告的读取长度高达30个碱基。Terry说，商业系统将有更长的和更短的读取长度可供选择。
虽然最初的概念证明描述了测序RNA测序，但Marcell说这个平台是“全基因组的”，可以测序RNA、DNA，甚至抗体或适体。但是，他指出，“市场的大漏洞是RNA。”传统的NGS提供了RNA分子的序列，但“不能告诉你它们的位置，也不能让你覆盖形态，”他说。
他说，有了FISSEQ，研究人员将能够获得序列信息、每个读取点的位置，以及带有读取点映射在图像中的高分辨率3D图像。
马塞尔说vwin德赢ac米兰合作，这项技术可能有很多应用，例如比较健康和患病组织。威斯研究所(Wyss Institute)的研究人员已经在利用该技术绘制大脑神经回路，今年1月，情报高级研究项目活动(Intelligence Advanced Research Projects Activity)获得了2100万美元的拨款。马塞尔表示，ReadCoor现在将承担大部分工作。他补充说，该公司还有几个与基因治疗、病原体鉴定和乳腺癌研究有关的其他项目正在筹备中。