纽约(基因组网新闻)-一项研究今天出现在网上科学暗示了一种沙门氏菌多药耐药感染的全球流行很少在人类和动物来源之间来回传播。
由威康基金会桑格研究所的研究人员领导的一个国际团队做到了数百人的基因组测序鼠伤寒沙门氏菌这是20多年来从苏格兰人类和动物身上收集到的分离物。该小组还对另外111个分离株进行了测序鼠伤寒沙门氏菌来自世界其他地方的菌株。
研究人员发现，从动物和人类身上提取的分离株的序列基本上聚集在不同的组中，每个组都含有不同的耐药基因谱。特别是，人类病原体往往在抗微生物药物耐药性基因中表现出更明显的遗传多样性，突出了明显缺乏广泛的混合鼠伤寒沙门氏菌感染动物。
“我们的数据提供了一个非常简单的信息，挑战了当地动物是主要来源的既定观点沙门氏菌桑格研究所的病原体基因组学研究员、资深作者尼古拉斯·汤姆森在一份声明中说。“这一发现将重新激发对抗生素耐药性来源的讨论沙门氏菌在其他环境中的人类感染。”
的鼠伤寒沙门氏菌名称是指从沙门氏菌血清属于血清鼠伤寒的肠道亚种。在目前的研究中，研究人员专注于一种形式的鼠伤寒沙门氏菌被称为最终104型，或DT104 -一种在人类和动物身上发现的菌株，导致了一系列的多重耐药沙门氏菌20世纪90年代在世界各地爆发。
该研究的作者指出:“DT104流行病很重要，因为它的广泛流行和公认的人畜共患性质，以及对广泛使用的抗微生物药物的高频率耐药性。”
为了深入研究DT104流行病的一个分支及其拟议的动物来源的细节，该小组对373人的基因组进行了测序沙门氏菌鼠伤寒DT104分离株。其中包括22年来在苏格兰收集的142个人类和120个动物分离物。其余的DT104分离株来自世界其他地区。
利用新测序的分离株和DT104参考基因组共享的核心序列中发现的snp，该团队能够梳理出它们之间的系统发育关系沙门氏菌沙门氏菌感染隔离。
这反过来又为DT104在苏格兰疫情期间的传播提供了线索，以及从同一地点收集的动物和人类分离物的相对遗传多样性。
“这是我们第一次详细地、大规模地确定如何做到这一点沙门氏菌该研究的第一作者、桑格研究所的博士后研究员艾莉森·马瑟在一份声明中说:“在同一环境和同一时期从人类和动物身上提取的菌株相互关联。”
他们的分析结果显示，与从同一地区的动物中收集的分离株相比，人类分离株及其抗微生物药物耐药性基因的遗传多样性有所提高，这与该地区的动物和人类感染可能源于不同来源的观点一致。
该小组特别指出了这种可能性沙门氏菌人与人之间传播的DT104分离株可能是通过进口食品搭便车到苏格兰的，也可能是在国际旅行者不知情的帮助下传播的。
即便如此，参与这项研究的人指出，还需要更多的研究来验证这一理论，并强调，分析的结果并不能证明对动物群体中发现的微生物的潜在暴露有松懈的看法。
该研究的合著者、皇家兽医学院的研究员斯图尔特·里德在一份声明中说:“这一发现绝不会削弱在所有物种中谨慎使用抗菌药物的重要性。”“但我们的研究确实表明，需要更大的努力来了解病原体的自然史，并确定全球生态系统中耐药性的主要来源。”