纽约——瑞典初创公司Single Technologies认为，通过使用更快的扫描系统和更小的流式细胞，可以提高依赖成像的测序平台的吞吐量，而无需改变测序化学成分。
这家总部位于斯德哥尔摩的公司大约有20名员工，正在开发一种新的测序系统，它相信该系统将在吞吐量方面与Illumina的NovaSeq竞争，甚至可能超过后者，同时进一步降低测序成本。
上个月该公司从瑞典投资公司JovB Holding和其他公司获得了1,500万瑞典克朗(合160万美元)。该公司计划在今年夏天前再筹集500万美元，用于开发一个人类全基因组测序平台。
首席执行官Johan Strömqvist表示，该公司源于他在皇家理工学院使用共聚焦成像技术研究活细胞中蛋白质相互作用的工作。vwin德赢ac米兰合作他说，当时这种技术非常缓慢。vwin德赢ac米兰合作他和创立了瑞典光纤公司Proximion的Bengt Sahlgren一起开始研究一种新的共聚焦扫描系统，该系统可以并行成像。
“这只是个开始，”他说。“我们很快意识到，这项技术可以用于基因组学，而不是蛋白质组学和单细胞应用，所以我们通过这个平台越来越多地转向基因组学。”因此，他和Sahlgren，以及Annika Bolind Bågenholm和Raoul Stubbe在2014年创立了Single Technologies。
该公司技术的一个方面是高度并行共聚焦扫描系统，该系统比现vwin德赢ac米兰合作有扫描仪速度快得多，可以加快测序成像过程。他说，目前该系统的速度大约是商用共聚焦扫描仪的100倍，到今年夏天，该系统有望达到800倍。
该扫描仪的灵敏度也非常高，原则上可以用于单分子测序，尽管该公司目前还没有努力实现这一点。Strömqvist表示:“我们对这个领域很感兴趣，但我们认为它还不够强大。”
该技术的另一个方面是该公司的流动电池，它使用纳米vwin德赢ac米兰合作流体代替微流体，从而使试剂体积更小，距离更短。它们还允许纳米图案。不过，这种流动电池不使用微通道，液体可以在大范围内快速交换。Strömqvist说:“它没有通常频道的限制。”“你可以把细胞、组织，甚至器官的一部分插入这个流动细胞，所以它是不同的。”他说，在新的流池上对反应进行测序可能会更有效，尽管该公司需要生成更多的数据来证明这一点。
他说，Single Technologies的扫描技术和流池在全球拥有多项专利和专利申请。vwin德赢ac米兰合作
该公司不打算开发自己的测序化学物质。相反，它计划与那些已经拥有有效测序化学方法的公司合作，无论是通过合成、杂交、连接或其他类型的方法进行测序。
“我们正在与测序化学公司合作，我们正在测试和验证他们的化学物质，”Strömqvist说，并补充说该公司已经与几家未具名的公司完成了试点研究，并参与了额外的非正式合作。这些化学物质应该允许300个碱基对量级的读取长度，使Single Technologies的平台直接进入短读取测序阵营。
他认为，围绕测序化学的合作对两家公司来说可能是双赢的。他说:“有我们在市场上，测序化学公司仍然会赚钱。”“只是市场会随着我们的系统而增长。”
尽管Illumina近年来针对Qiagen(凯杰)和华大基因(BGI)等竞争对手主张其测序化学专利，但Single Technologies并未因此却步。Strömqvist说:“许多(测序的)化学专利将在未来几年到期，所以我认为情况将会改变。”
从长远来看，Single Technologies计划以低成本向核心设施或其他需要大量测序数据的机构出售高通量测序系统。他说，这对目前受测序成本限制的单细胞测序项目尤其有用。他补充说，其目标不仅是提供测序平台，而且是基础设施和软件，用于基站呼叫和数据存储。
目前，该公司正在通过生成测序数据来展示其技术。vwin德赢ac米兰合作他说:“我们现在的重点领域是生成NGS数据，并将这一仪器提高到可以开始对整个基因组进行测序的水平。”该公司希望在12到15个月内实现这一目标。
此外，Single Technologies的平台可以用于原位RNA测序是该公司与瑞典科学实验室(SciLifeLab)的Mats Nilsson合作多年的一项应用。“之前，我们已经生成了大量的数据原位测序空间，”Strömqvist说。但目前，我们的重点是NGS。”
另一家瑞典创业公司Cartana，最近出来将尼尔森实验室商业化原位RNA-seq，而空间转录组学，an原位转录组学公司是从另一个sciilifelab团队分离出来的，收购由10x基因组公司在2018年推出。
Strömqvist说:“我们认为我们在这个领域有一个很好的平台。”并补充说，Single Technologies与几家已经开发出该产品的公司保持着合作原位可以用于人类细胞图谱等项目的RNA-seq化学。“但从商业角度来看，我们认为这还处于非常早期的阶段，所以我们目前专注于NGS，”他说。
不过，从长远来看，Single Technologies的平台“可能是10x [Genomics]的一个很好的补充”原位RNA-seq,他补充说。