纽约——根据一项新的基于系统生物学的分析,性别特异性基因调控特征似乎在人类组织中广泛出现。
对于一个纸出现在细胞的报道周二,来自美国、台湾、挪威和法国的研究人员将代表近500名健康基因型-组织表达(GTEx)项目参与者29种组织类型的基因调节网络整合在一起。从由此产生的近8300个网络中,他们记录了转录因子靶向和活性的明显性别相关差异,尽管在大多数考虑的组织中存在相对微妙的性别相关表达差异。
“我们的研究结果提供了性别偏见的监管过程及其监管驱动因素,”由Brigham妇女医院和哈佛大学的联合通讯作者Dawn DeMeo和John Quackenbush领导的研究人员写道。他们进一步指出,这些发现“强调了在基因调控中考虑系统层面差异的重要性,以理解性别差异对健康和疾病的影响。”
研究小组认为,新的基因调控网络集合可能有助于通过性别和组织特异性的视角来解释未来生物学和疾病研究的发现,使研究人员更接近设计临床和研究研究的目标,考虑参与者的性别及其影响。
作者写道:“性别差异已经被认为是人类疾病中最重要的未被充分研究的方面。”“从历史上看,性别没有得到适当的考虑,许多实验研究只在男性身上进行,性染色体被排除在分析之外,序列映射协议没有考虑到性染色体的偏差。”
除了用一种名为voom的工具对29种组织类型中的组织特异性和性别特异性基因表达进行分析外,研究人员还结合了8279个样本(由360名男性和188名女性GTEx参与者贡献)的RNA测序谱,以及转录因子结合基元、蛋白质-蛋白质相互作用和其他可用线索的可用数据,用称为PANDA和LIONESS的建模方法将每个样本的单个基因调控网络放在一起。
虽然在非性染色体上,性别之间的基因表达差异相对较小,通常发生在已知的性别特异性表达的组织和途径中,研究小组报告说,男性和女性参与者的基因调控差异普遍存在,部分原因是不同的转录因子靶点。
作者写道:“我们发现基因调控过程在组织中因性别而异,许多[转录因子]具有性别偏向的靶向模式。”作者指出,“男性和女性之间靶向差异的基因在疾病和组织相关功能方面丰富。”
此外,他们称目前的结果“在理解性别差异如何在基因调控网络中体现方面迈出了重要一步,并强调了超越基因表达的重要性。”