纽约(GenomeWeb)——据设计该应用程序的科学家说，丰田公司开发了一种新的基因分型测序方法，它很快将更广泛地用于农业研究。
这家日本跨国公司的研究员Hiroyuki Enoki告诉GenomeWeb，该公司的技术被称为随机扩增子测序基因分型(GRAS)，可以提高识别和选择作物改良标记的效率。vwin德赢ac米兰合作
他说，丰田与日本国家农业和食品研究组织(NARO)下属的九州冲绳农业研究中vwin德赢ac米兰合作心(KARC)合作开发了GRAS技术。Enoki说，丰田一直在与该中心合作，开发甘蔗等作物作为替代生物燃料来源。
Enoki说:“从甘蔗开始，我们一直在开发各种能源作物，目的是提高生物质产量。”“作为这些措施的一部分，我们自2007年以来一直与NARO开展联合研究项目，后者在能源作物研究和开发方面拥有丰富的经验。”
这项工作已经产生了一小部分与识别各种甘蔗品种有关的专有标记，Enoki和他的同事还开发了一种基于微阵列的标记检测方法。
Enoki本周指出，虽然这项技术可以用来识别与各种植物性状相关的某些标记，但vwin德赢ac米兰合作要广泛采用，它仍然过于昂贵和耗时。
为了克服这些挑战，丰田将内部开发的样品制备技术与下一代测序仪器结合起来，创造了GRAS, Enoki声称该技术可以用其他方法十分之一的时间分析DNA，成本只有其他方法的三分之一。vwin德赢ac米兰合作他指出，这vwin德赢ac米兰合作种技术最终可以用于提高甘蔗产量，并增加生物燃料作物的产量。
丰田方法的核心是其样本准备技术，Enoki表示，该技术可以使用内部开发的引物放大基因组中的数万个位vwin德赢ac米兰合作置。他说，更具体地说，这种方法包括两个PCR步骤和一个纯化步骤，而且“非常简单”。所使用的引物组是稳定的，基因组信息在初步设计中不需要，因为第一步PCR可以用随机引物组扩增数千个基因组片段，因此称为随机扩增子测序。
此外，通过第二步PCR，丰田公司的研究人员能够将引物连接到适配器上。Enoki说:“通常，随机引物的PCR是不稳定的。”“我们已经发现并定义了一种使用随机引物进行稳定PCR的方案。”
丰田及其合作伙伴使用Illumina HiSeq2500仪器作为GRAS平台的一部分。Enoki说，丰田公司去年开发了这种方法。
该公司目前正在公开讨论GRAS平台。本周，在鸟取市举行的日本育种学会年会上，丰田展示了这项技术的细节，以及与NARO合作的分析结vwin德赢ac米兰合作果。
Enoki说:“会议上分享的信息是，样品制备非常容易，因为它使用两个PCR[步骤]和一个纯化[步骤]，不需要专门的设备。”“我们的技vwin德赢ac米兰合作术可以提供成千上万的(基因型)，准确率高于99.9%，并且很少有缺失值，在水稻和甘蔗种群中不到1%。”
丰田现在渴望看到其平台被农业部门采用。为此，它获得了位于千叶的Kazusa DNA研究所的帮助，该研究所曾参与大规模的植物和细菌基因组测序，并以解码番茄和草莓基因组而闻名。Kazusa现在将评估GRAS方法的性能。
“我们希望从专家的角度获得全面的评估，”Enoki谈到与Kazusa的合作时说。“特别是，由于有很多种作物种子可供选择，我们正在寻找基于多种作物的技术评估。”
虽然迄今为止，GRAS的主要应用领域是识别可能提高生物燃料作物产量的标记，如抗病甘蔗品种，但Enoki表示，该技术也可以用于提高粮食作物的产量，丰田将继续提高对GRAS在农业领域的使用的认识和讨论。vwin德赢ac米兰合作
这在一定程度上意味着，丰田愿意将GRAS技术提供给其他想要获得这项技术的公司。vwin德赢ac米兰合作
Enoki说:“我们相信这项技术有更广泛的社vwin德赢ac米兰合作会意义，也可以用来帮助增加粮食作物的产量，帮助保护环境。”“因此，我们希望这项技术能得到广泛应用，”他说。vwin德赢ac米兰合作“因此，尽管这取决于调查的具体细节，但我们打算积极回应其他公司关于提供这项技术的请求。”vwin德赢ac米兰合作
至于GRAS商业化的计划，Enoki表示，未来丰田将根据不同情况，继续权衡将技术提供给第三方的最佳方式。vwin德赢ac米兰合作虽然它的主要应用领域是农业研究，特别是那些还没有详细遗传信息的作物，但他暗示，它最终可能被用于其他目的。
他说:“从理论上讲，我们认为这项技术也适用于其他生物，包括人类。”vwin德赢ac米兰合作