纽约——英国的研究人员已经证明了全基因组测序在检测神经重复扩张障碍方面优于传统方法的能力，这使得WGS被用作疑似患有这种疾病的患者的常规诊断测试成为可能。
的研究发表在《柳叶刀神经病学来自伦敦玛丽女王大学、伦敦大学学院、Illumina公司、英国基因组公司和英国国家卫生服务机构的研究人员参与了这项研究。
重复扩增障碍是一种临床异质性疾病，每3000人中约有1人受影响，由短串联DNA重复片段的扩增引起。这类疾病的例子包括脆性X染色体综合征、亨廷顿舞蹈病、弗里德里奇共济失调和某些形式的肌萎缩性侧索硬化症。
迄今为止，检测依赖于PCR来评估患者的特定基因组位点，但正如作者所指出的，这导致了对非典型表现或缺乏家族史的患者的诊断不足。正如英国国民医疗服务体系已经依赖将全基因组测序作为诊断罕见疾病的一线测试，研究人员决定将他们的项目重点放在这组疾病上。
在这项研究中，他们回溯性地观察了全基因组测序的准确性，以检测与神经结果相关的13个最常见的重复扩增位点，使用的样本来自被认为患有神经疾病的NHS患者，这些患者在2013年至2017年期间被招募为10万基因组项目的一部分。他们使用早期的404例患者的PCR检测结果作为参考标准。当患者样本的全基因组测序导致重复的扩增呼叫时，他们再次使用PCR来确认这些呼叫。
据作者称，与PCR结果相比，全基因组测序在检测13个基因座的重复扩增时具有97.3%的敏感性和99.6%的特异性。
作者还从“10万基因组计划”的11631名疑似重复扩增的未确诊患者的临床特征中研究了样本。他们能够标记81个重复扩张，其中68个在完整的致病范围内，为这些患者提供诊断。
作者总结道:“这些发现支持在临床实验室实施全基因组测序，以诊断与重复扩张障碍相一致的神经表现的患者。”
他们指出，患有这些疾病的人往往需要漫长的诊断过程，需要进行各种测试。基于他们的发现，全基因组测序可以取代使用多种测试来对患者进行诊断。
伦敦玛丽女王大学教授、英国基因组学公司前首席技术官马克·考尔菲尔德(Mark Caulfield)说:“目前，诊断这种神经障碍通常取决于患者是否有这种疾病的家族史或特定的临床症状。”“通过全基因组测序，我们可以检测出这些和新的重复扩张疾病。”
考尔菲尔德说，这项研究“代表了全基因组应用方面的重大进步，使以前意想不到的遗传性神经疾病得以检测。”