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联盟检测预测丙型肝炎治疗反应的基因

纽约(基因组网新闻)-根据昨晚在网上发表的一项研究,一小部分免疫相关基因的遗传变异可以帮助预测哪些人对慢性丙型肝炎病毒感染的治疗有反应《公共科学图书馆·医学》杂志上

在一个研究对象超过1100人国际丙型肝炎遗传学联盟的成员发现,一些基因的变异可以区分慢性丙型肝炎感染者对治疗有反应或没有反应。其中一个基因IL28B的变异与治疗相关和自发清除病毒相对应。另一方面,KIR和HLA-C基因的变异版本仅与治疗相关的清除相关。

除了他们对自发和治疗相关的HCV反应的途径所提供的见解之外,这项研究的发现也可能有助于确定哪些患者最有可能从现有的HCV治疗中受益。

“目前的研究具体探讨了IL28V和KIR/HKA-C基因位点对HCV清除(自发或治疗诱导)是否有单独、相加或相互作用的影响,”悉尼大学免疫学和过敏研究人员David Booth及其合著者写道。“这一信息对于更好地理解IL28B在HCV感染期间的作用,更好地预测对治疗的反应,并可能更好地选择患者进行治疗至关重要。”

研究人员解释说,聚乙二醇化干扰素- α和利巴韦林药物的联合使用,可有效治疗多达一半的HCV 1型慢性感染者,这是最常见的HCV基因型。先前的相关研究已经确定了白细胞介素28B基因IL28B的变异与治疗成功和自发的HCV清除相对应,促使IL28B基因分型在临床实践中的使用。

尽管如此,他们推断,通过添加其他免疫相关基因的信息,可能进一步完善和改进IL28B基因分型所提供的预测信息:编码免疫球蛋白样受体的人类白细胞抗原基因HLA-C和KIR基因。

研究人员使用PCR或基于靶向测序的方法对1100多名来自意大利或澳大利亚的患有慢性HCV基因型1感染的欧洲血统患者的HLA-C、IL28B和几个KIR基因(KIR2DL2、KIR2DL3、KIR2DS1和KIR2DS2)进行基因分型。

然后,他们观察了这些基因的变异是否能将417个在聚乙二醇干扰素和利巴韦林治疗后有效清除病毒的个体与493个治疗失败的个体区分开来。该团队还对另外234名来自澳大利亚或德国的患者进行了基因分型,这些患者自发地患上了这种疾病。

研究人员报告说,正如过去的研究所预期的那样,IL28B的一个被称为rs8099917的SNP对应于治疗后或自发的病毒清除。

与此同时,HLA-C基因的变异似乎有望预测治疗结果,但不能预测哪些患者会自发清除HCV——这一模式与HCV治疗与先天免疫系统中的自然杀伤细胞联合工作的概念是一致的。拥有两个HLA-C2副本而不是HLA-C1副本的个体对HCV治疗的反应较小。

结合HLA-C和IL28B基因的信息尤其有信息量:而IL28B基因分型单独可以预测大约三分之二的治疗失败,添加HLA-C基因信息使这一预测水平提高到80%左右。

研究作者报告说,KIR2DL3和KIR2DS2基因型可能提供一些预测信息,尽管这些基因似乎通过与HLA-C和IL28B基因相互作用来影响治疗结果。

尽管如此,研究人员说,还需要更多的研究来确定在感染HCV的欧洲个体中与治疗反应相关的相同变异是否可以扩展到其他人群。

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